# Appareils Biologie / Chimie
# Appareils de l'espace Biologie / Chimie
Retrouvez également la liste des principaux équipements [sur notre site internet](https://fablab.sorbonne-universite.fr/propos-du-fablab/les-espaces-et-equipements).
**Le Fablab Biologie Chimie se situe tour 43-44 au 2ème étage**
#### Imprimantes 3D résine
**2 imprimantes Elegoo Saturn**
- Description : Impression par photopolymérisation en cuve, technologie LED
- Volume maximal d'impression : 192 mm\* 120 mm\*200 mm
- Épaisseur minimum des couches : 10µm
- Épaisseur maximum des couches : 150µm
- Matières compatible : résine
- Logiciel : Chitubox
- Formats de fichiers requis : stl, obj
**1 imprimante Elegoo Mars 2**
- Description : Impression par photopolymérisation en cuve, technologie LED
- Volume maximal d'impression : .....
- Épaisseur minimum des couches : .... µm
- Épaisseur maximum des couches : ... µm
- Matières compatible : résine
- Logiciel : Chitubox
- Formats de fichiers requis : stl, obj
#### Autre équipements
*Nom de la machine* | *Modèle* | *Fabricant* |
Agitateur 2D | KS 501 | IKA Labor Technik |
Agitateur 2D vitesse variable | STD 1000 | VWR |
Agitateur à balance | Rocking platform | VWR |
Agitateur basculant 3D | SSL3 | Stuart |
Agitateur magnétique avec ou sans potence | MR Hei-Mix S PVDF | Heidolph |
Agitateur magnétique chauffant |
| IKA RCT |
Agitateur rotatif chauffant | VMS-A | VWR |
Autoclave | Vapour-line lite | VWR |
Bain à sec pour micro-tubes | SBH 130B | Stuart |
Bain marie métallique petit volume (100°C) |
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Bain marie plexiglas 5L 65°C |
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Balance 0.001 | Practum | Sartorius |
Balance 0.1g 210g max | EC211 | Acculab |
Balance d'analyse max 320 g à 0,1 mg | ABS 320-4M | Kern |
Balance de précision 0.001 (120g max) | LA124 | VWR |
Balance de précision max 3200 g à 0,01g | PNS 3000-2 | Kern |
Banc Kofler |
| Wagner & Munz |
Bec électrique Hofmann avec régulateur |
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Bulleur d'aquarium |
| Superfish |
Centrifugeuse de paillasse 8x 2/1,5ml | Frontier Mini FC5306 | Ohaus |
Centrifugeuse pour micro-tubes de paillasse | MC12 | Benchmark |
Centrifugeuse réfrigirée (micro tubes : 1,5 et 2 mL et falcon : 15 et 50 mL) | Sirena | Afi |
Chauffage et pompe filtrante pour aquarium |
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Chauffe ballon (100/250mL) |
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Cloche à vide + tuyau |
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Conductimètre de paillasse avec capteur LE703 | FiveEasy F30-Standard kit | Mettler |
Déshydrateur alimentaire |
| Gorenje |
Dessicateur électronique | MB23 | OHAUS |
Disperseur homogénéiseur | T 18 digital | Ultra-Turrax |
Electrophorèse WesternBlot (cuve pour migration et transfert, système de coulage du gel…) |
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Etuve universelle ventilée 112 litres +300°C | XUE112 | France étuves |
Four chaleur tournante |
| Severin |
Générateur d'ozone |
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Sorbonne fixe |
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Hotte à flux laminaire | Optigel 12 | ADS Laminaire |
Hotte chimique mobile + filtre | Captair | Erlab |
Imageur (UV et lum. blanche) | 200 | Azure biosystems |
Incubateur agitant | IncuShaker 10L | Benchmark |
Incubateur agitant modulable | Unimax 1010/Incubateur 1000 | Heidolph |
Incubateur fixe | Heratherm IGS60 | Thermo Scientific |
Incubateur fixe | Incu-line | VWR |
Incubateur réfrigéré à convection forcée 240 litres | BRE240 | Froilabo |
Lampe à alcool |
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Machine à glace en paillettes | GB 902A | Brema |
Marie jeanne avec bulleur |
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Micro-ondes 27L |
| Sharp |
Microscope binoculaire | B-192PL 1000X | Optika |
Oxygraphe complet (cellule, sonde à oxygène avec agitateur, table traçante) | L200E | Linseis |
pH/mV/redox-mètre de paillasse | FiveEasy pH F20-Standard kit | Mettler |
Phytotron | IPP 260+ | Memmert |
Pompe à vide | N022AN | KNF |
Pompe de recirculation pour aquarium | AT808 |
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Pompe filtrante pour bassin 440L/h | 2213 | Eheim |
Roto-évaporateur |
| Heidolph |
Roue à micro-tubes à vitesse fixe |
| VWR |
Spectromètre FT-IR | Spectrum Two | PerkinElmer |
Spectrophotomètre UV-visible | Libras 22 | Biochrome |
Spectrophotomètre UV-visible à balayage spectral | 7615 Blanc | Jenway |
Stérilisateur UV | CHS208A |
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Système de filtration Résine pour production d'eau distillée | E200 | Veolia |
Table chauffante céramique diam. 28 cm |
| Kalorik |
Table UV | TFP 20M | Bio Bloc Scientific |
Thermocyleur affichage numérique | XT96 | VWR |
Thermo-hygromètre digital programmable | 0172 SI | IHM |
Vortex à vitesse variable |
| Stuart |
Warburg (incomplet) |
| B. Braun |
# Agitateur magnétique
Appareil permettant l’homogénéisation d'une solution via l'agitation par un moteur à vitesse variable d'un barreau aimanté
# Guide d'utilisation agitateur magnétique sans potence
#### **Présentation des appareils**
Heidolph / Hei-Mix-S
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/heidolph-agitateur-magnetique.jpeg)
**Plage de vitesse de rotation** **:** jusqu'à 2200 tours/minute
**Précision de la vitesse :** ± 5 %
**Capacité volumique d'agitation :** jusqu'à 5L
| Prolabo / SR100
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/prolabo-sr100-agitateur-magnetique.jpeg)
**Plage de vitesse de rotation :** jusqu'à 1000 tours/minute
**Capacité volumique d'agitation :** jusqu'à 500mL-1L
| Hanna instruments / Magnetic stirrer HI 190M
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/hanna-instruments-agitateur-magnetique.jpeg)
**Plage de vitesse de rotation :** 100 à 1000 tours/minute
**Capacité volumique d'agitation :** jusqu'à 1L
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Prolabao / agitateur magnétique
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/prolabo-agitateur-magnetique.jpeg)
| IKA MINI MR
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/jk-agitateur-magnetique.jpeg)
| Barreaux aimantés et tige de récupération
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/localisation-barreaux-aimantes-et-tige-2.jpeg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/v04barreaux-aimantes.jpeg)
Barreaux aimantés de différentes tailles qui supportent l'autoclave
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#### **Mode d'emploi**
1. Poser sa solution sur l'appareil selon la capacité volumique de celui-ci
2. Choisir une taille de barreau aimanté et le mettre dans la solution nb: le barreau supporte l'autoclave
3. Brancher l'appareil à une prise
4. (Passer cette étape si utilisation appareil IKA ou Hanna Instruments ) : Allumer l'appareil en appuyant sur le bouton on- Heidolph : noir- Prolabo SR100 : vert power- Prolabo : rouge secteur (le voyant s'illumine)
5. Choisir la vitesse de rotation
6. Une fois la solution homogénéisé, mettre la vitesse de rotation sur 0
7. (Passer cette étape si utilisation appareil IKA ou Hanna Instruments ) Mettre l'appareil sur off
8. Débrancher l'appareil
9. Le barreau aimanté est à retirer avec la tige de récupération blanche
10. Laver le barreau aimanté et la tige de récupération utilisés avant de les ranger
# AutoClave de paillasse: Pression max 1.08bar (121°C)
# Utilisation de l'AutoClave de paillasse
#### **Taches à verifier**
1. Vérifier branchement à l’alimentation.
2. Vérifier que rien autour n'empêche l’évacuation de l’air, laisser les bouchons sur le couvercle : ils sont essentiels au bon fonctionnement de la machine !
3. Introduire de l’eau distillée jusqu'à couvrir le système de chauffe + 500 mL par 20 min d’utilisation (on utilise de l’eau distillée pour éviter les dépôts calcaire.)
4. Le programme est déjà prêt ! Ne pas modifier.
5. Appuyer sur le bouton vert pour allumer, puis le bouton noir pour allumer l'écran de programmation/affichage, quand s’affiche t°C 23 (ambiante) et 105 (température de stérilisation.) Appuyer sur start pendant 3 sec.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/autoclave4.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/autoclave1.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/autoclave2.jpg)
6. Vérifier la jauge de pression durant l’utilisation : 105°C=2.90PSI.
[ ](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/autoclave3.jpg)
7. Pour éteindre, appuyer sur le bouton start/stop quelques secondes, puis appuyer sur l'interrupteur noir puis vert.
8. Attendre le refroidissement pour ouvrir et récupérer le matériel autoclavé.
# Balance de précision
Balance sous cloche permettant des pesées fines au mg.
# Balance de précision
#### Présentation de l'appareil
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-10/v4Fimg-3636.PNG)
Comme son nom l'indique, cet appareil permet de mesurer des masses de façon précise à 0,0001mg près. La balance est composée d'une cloche s'ouvrant grâce à des portes coulissantes, sur les cotés et le haut de l'appareil. Sous la cloche, on peut trouver au centre le capteur de pesée. Enfin, en dehors de la cloche, on a l'écran ainsi que six touches pour notamment allumer/éteindre ou calibrer l'appareil. Cette balance permet de faire des mesures jusqu'à 320g.
#### Précautions d'emploi
- **Ne pas déplacer la balance**, au risque de changer la calibration
- Ouvrir et fermer les portes coulissantes avec soin
#### Mode d'emploi
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-10/img-3637.PNG)
- Allumer la balance et vérifier que la bille de calibration se trouve bien dans le cercle rouge, sinon recalibrer la balance
- Poser au centre du capteur de pesée, la coupelle de mesure
- Tarer la masse de coupelle
- Procéder à la pesée de votre produit, tout en veillant à ne pas en mettre partout
- Fermer les portes coulissantes afin d'obtenir la mesure la plus précise
- Une fois, la mesure terminée, **nettoyer l'intérieur de la cloche**
# Banc Kofler
Un appareil permettant de déterminer le point de fusion d'un élément chimique
# Banc Kofler
#### Présentation de l'appareil
Le banc Kofler est un appareil permettant la détermination du point de fusion (passage de l'état solide à l'état liquide) d'un élément chimique avec une précision à 2 degrés près. Pour cela, l'appareil va chauffer un banc métallique grâce à des résistances thermiques selon un gradient de droite à gauche, du moins chaud au plus chaud. Ce banc Kofler peut s'utiliser pour déterminer des points de fusion d'éléments chimiques compris entre 50 et 260°C.
#### Matériel
#### Consignes de sécurité
- - Ne pas porter de **gants** (ils risqueraient de fondre)
- Le banc Kofler est **chaud** lors de son utilisation : il faut donc faire attention à ne pas se brûler, y compris avec la spatule
- Vérifier les **pictogrammes** des éléments étudiés : certains éléments peuvent libérer des fumées dangereuses lors de leur évaporation. A ce moment-là, il faudra utiliser le banc Kofler sous la sorbonne (enceinte ventilée qui protège l'utilisateur des fumées néfastes)
- Porter une **blouse** tout le long de la manipulation
#### Utilisation de l'appareil
- Pour allumer l'appareil, le brancher et appuyer sur l'interrupteur : quand il est rouge, l'appareil est allumé :[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-09/20230926-155013.jpg)
- L'appareil est chaud quand le voyant vert **clignote** :
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-09/20230926-155015.jpg)
#### Étalonnage de l'appareil
Avant toute mesure et **entre** chaque mesure, l'appareil doit être étalonné, afin d'avoir une meilleure précision dans la détermination du point de fusion du produit d'intérêt.
Dans le cas où la température de fusion du produit est inconnue, il faut déterminer vers quelle température il fond, afin de choisir le bon étalon. Ainsi, avant d'étalonner proprement le banc, on suit les cinq premières étapes du protocole ci-dessous. Une fois que la gamme de température de fusion du produit a été déterminée, on peut étalonner l'appareil. Pour cela, on choisit l'étalon dont la température de fusion connue est la plus proche de la gamme que l'on vient de déterminer et on suit le protocole suivant et ce, jusqu'à la fin :
1. Nettoyer le banc Kofler et la spatule à l'aide d'un chiffon imbibé d'éthanol
2. Sélectionner le bon étalon : l'étalon doit avoir un point de fusion proche mais toujours inférieur à celui attendu pour l'échantillon. (Les étalons sont à demander aux responsables du FabLab - Steve Hubert ou Simon Lanis)
Dans ce cas-ci, le point de fusion de l'échantillon est attendu aux alentours de 120°C : on va donc choisir l'étalon à 113.9 °C.
3. Prélever une très petite quantité de l'étalon avec la spatule et la mettre du côté le plus froid du banc (le côté droit)
4. Former une diagonale fine avec la spatule et la faire glisser lentement vers la gauche
5. Lorsque l'étalon commence à fondre, s'arrêter et pointer la température correspondante avec l'aiguille (pas besoin de pointer avec l'aiguille s'il s'agit de déterminer la gamme de température de fusion)
6. Ajuster la petite aiguille jusqu'à la température connue de l'échantillon. Ici, c'est 113, 9°C (donc arrondi à 114°C)
7. Avec la pissette d'éthanol et un chiffon, nettoyer (sans se brûler) le banc, la spatule et l'aiguille.
8. Le banc est prêt à être utilisé ! :)
#### Déroulement de la mesure
Après le nettoyage du banc, de l'aiguille et de la spatule, de même qu'avec l'étalonnage, on peut prélever une petite quantité de l'élément à tester avec la spatule, former une fine diagonale avec l’élément et la décaler jusqu'à observation de sa fusion. Ensuite, on peut faire glisser la grande aiguille pour qu'elle pointe la limite entre les états liquide et solide de l'élément. La température affichée par la petite aiguille est celle recherchée.
Après utilisation du banc, faire attention à nettoyer de nouveau le matériel, à froid.
# Centrifugeuse réfrigérée
Centrifugeuse à rotor interchangeables (1,5mL, 15mL, 50mL), permettant de travailler dans une gamme de température allant de l'ambiante à 4°C ou moins. 17000 rpm max.
# Consignes d'utilisation : Centrifugeuse réfigérée (sirena)
**Allumer** en maintenant appuyer le bouton power
**Choisir un programme** : appuyer sur + ou -
**Lancer une centrifugation** : appuyer brièvement sur power
**Modifier un programme :**
⦁ choisir le programme à modifier avec le '+' ou '-'
⦁ maintenir longtemps la barre tactile en bas de l'écran jusqu'à ce que la vitesse se mette a clignoter
(pour modifier la durée, appuyer une fois de plus brièvement et suivez le protocole )
(pour modifier la température, appuyer 2 fois )
(pour modifier accélération, appuyer 3 fois)
⦁ Modifier la valeur avec le '+' et le '-'
⦁ Pour valider le programme, appuyer brièvement 6 fois sur la barre en bas de l’écran.
(pour la durée, appuyer 5 fois brièvement pour valider)
(pour la température, appuyer 4 fois brièvement pour valider)
(pour l'accélération , appuyer 3 fois brièvement pour valider)
cela validera les autres paramètres non modifiés
**Utiliser le programme:**
⦁ choisir le programme avec le '+' et '-'
⦁ mettre les tubes dans le rotor et fermer le couvercle
⦁ appuyer brièvement sur le bouton power
lorsque les conditions du programme sont atteintes, il est affiché un 'OK'
**les unités par défauts :**
vitesse: tour par min (rpm)
durée: min:sec
température : degré Celsius
pente d'Accélération : plus la valeur est grande, plus le temps d’accélération diminue
# Chambre climatique
Enceinte thermostatée permettant de réguler la température intérieure en positif et en négatif par rapport à la température ambiante.
# Chlorophyll meter SPAD-502Plus
Chlorophylle mètre
# Mode d'emploi
#### **Présentation de l’appareil**
**[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/chlorophyll-meter.jpeg)**
Cet appareil permet de mesurer la teneur en chlorophylle de feuilles de plantes.
Unité utilisé : SPAD
Conversion : 2 SPAD = 0.9960 +-6% nmol/cm^2 ou 0.9809 +-6% nmol/mg de chlorophylle
Zone de mesure : 2mm x 3mm
Épaisseur max. : 1.2mm
#### **Mode d'emploi**
Allumage :
1- Tourner le bouton sur "on" et attendre que l'appareil affiche "calibrage"
2- Faire une mesure à vide pour calibrer et en cas de problème répéter l'opération
3- Faire ses mesures
Autres fonctions utiles :
Utiliser le butoir :
\- Retirer le butoir et le remettre dans l'autre sens
\- Régler la profondeur souhaiter suivant les besoins
Insérer une compensation :
\- Appuyer sur "average" et "data recall" à l'allumage
\- Régler la compensation souhaité avec les boutons "all data clear" et "1 data delet"
\- Appuyer sur "average" pour valider
\- Éteindre et rallumer l'appareil
\- Faire ses mesures normalement
Pour retirer la compensation : la régler sur 0.0
Vérifier que l'appareil fonctionne correctement :
\- Appuyer sur "data recall" et "1 data delete" à l'allumage pour lancer le "check mode"
\- Retirer le butoir
\- Insérer le témoin
\- Faire quelques mesures
\- Vérifier en appuyant sur "average" que la valeur se trouve dans la marge d'erreur du témoin
# Compteur automatique de colonies
VWR®Auto lite
EUROPEAN CATALOGUE NUMBER: 710-2072
Cet appareil permet de compter automatiquement le nombre de colonies présentes dans un échantillon donné, grâce à un algorithme.
# Guide d'utilisation
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/img-0178.jpg)
Si vous avez besoin de plus de renseignements que ceux présents sur cette page, vous pouvez consulter le manuel d'utilisateur en anglais [ici](https://fr.vwr.com/assetsvc/asset/fr_FR/id/35416263/contents/manual-vwr-colony-counter-auto-lite-en-200521.pdf "Manuel d'utilisation")
#### 1. Allumage de l'appareil
- Brancher la prise d'alimentation de l'appareil
- Brancher la machine à l'ordinateur via son câble USB
- Brancher la clé USB produit (violette) sur l'ordinateur
- Ouvrir le logiciel avec clic droit **exécuter en tant qu’administrateur** en demandant gentiment le code au Fabmanager
- Éclairer la zone en sélectionnant un des 3 modes d’éclairage à l’aide de l’unique bouton noir sur la face avant
- Placer la boîte de pétri fermée
#### 2. Comptage :
##### a. d'une nouvelle série
- Créer une nouvelle série
- Sélectionner le type de lot approprié : ''Boîte ensemencée en masse'', ''Boîte ensemencée en spirale'' avec ou sans dilution
- Calibrer l’échelle dans ''Configuration de la boite'' avec une distance connue (avec une règle ou avec le diamètre de la boite) ainsi que les facteurs de dilution en spirale ou la taille maximale des colonies
- Régler l'exposition avec le curseur dans l'onglet ''Image''
- Cliquer sur “Comptage total de boîtes” dans l'onglet ''Classification'' pour choisir si les colonies sont plus/moins claires que le fond (utiliser le disque noir si besoin pour augmenter le contrasteUne fois la création de la série validée, vous ne pourrez plus modifier ce paramètre
- Ajuster la sensibilité et la taille minimum des colonies mesurées dans la même fenêtre avec les curseurs-> Vous pouvez alors visualiser les colonies marquées par le logiciel, et choisir la couleur ou les balises permettant de repérer les colonies
- Nommer votre boîte de Pétri de référence dans l'onglet ''Mesurer''
- Modifier le facteur de dilution selon vos besoins dans la case ''Plate ID''
- Effectuer une mesure test pour vérifier que le logiciel identifie bien toutes les colonies en appuyant sur l'icône ''Mesure de la boîte Test"
- Dans l'onglet ''Résultats'', vous pouvez sélectionner les paramètres retenus
- Dans l'onglet ''Configuration'', vous pouvez définir le mode de dénomination des différentes boîtes : par incrémentation, par code-barre ou d'après une liste d'échantillons pré-existante
- Pour finaliser la création de la série, lui donner un nom dans le rectangle ''Dénomination de la série''
Sans nom, vous ne pourrez pas créer votre série
- Cliquer sur ''Accepter la série''
##### b. d'une série préexistante
- Cliquer sur ''Ouvrir série"
- Sélectionner la série de votre choix
- Reprendre le comptage où vous l'aviez laissé
- **A la fin de l'utilisation** : fermer votre série dans le gestionnaire de série et aller dans réglage --> quitter Autolite
#### 3. Résultats
Si vous le souhaitez, le logiciel peut conformer pour vous les résultats sous la forme d'un compte-rendu. Pour cela :
- Aller dans le menu ''Autolite'' en haut à gauche
- Sélectionner ''Exporter les données''
- Choisir le dossier d'arrivée et exporter vos données
# Présentation de l'appareil
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/w65image.png)
Le compteur de colonies vous permet d'obtenir une approximation du nombre de colonies présentes dans une boîte de Pétri, grâce à l'utilisation d'un logiciel Autolite affilié et d'une caméra présente dans l'appareil. Celle-ci vous permet d'obtenir des images en directes de vos colonies. Les paramètres mesurés sont ensuite fournis sous la forme d'un compte-rendu, directement fourni par le logiciel.
Pour plus d'informations sur ce modèle, vous pouvez vous rendre sur le site du fabricant [ici](https://fr.vwr.com/store/product/34973691/vwr-auto-i-lite-i-compteur-automatique-de-colonies "Lien fabricant Autolite")
Cet appareil présente des avantages :
Permet une estimation rapide du nombre de colonies d'un échantillon
Permet d'effectuer cette estimation avec les mêmes paramètres sur un grand nombre d'échantillons
Permet d'obtenir des résultats déjà formatés
Mais aussi des inconvénients :
Ne fonctionne que pour les colonies contrastées
Ne produit qu'une aide au comptage, et non un comptage parfaitement précis
Tous ces paramètres sont à prendre en compte au moment des mesures.
# Conductimètre
Appareil permettant la mesure de conductimétrie dans un liquide. La conductimétrie se caractérise par les propriétés des solutions de laisser passer un courant électrique grâce aux ions. La conductimétrie permet d'évaluer quantitativement la concentration de la solution à haute précision.
# Cuve d'électrophorèse
La cuve d’électrophorèse est utilisée dans l'électrophorèse sur gel d'agarose. Elle permet de contenir le tampon de migration.
# Cuve d'électrophorèse avec visualisaton en direct de la migration
#### Appareil d'électrophorèse en temps réel
Le modèle VWR® Real Time Electrophoresis System permet de couler un grand gel ou deux petits gels d'agarose en même temps, puis de faire migrer vos extraits d'acides nucléiques (ADN, ARN), tout en les visualisant grâce à un appareil transilluminateur, emboîtable en dessous de la cuve de migration.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/28359938.jpg)
#### Consignes
L'appareil doit être branché à un réseau de 100~120 VCA. Sinon il faut utiliser le transformateur pour un réseau de 220 VCA !!!
Ne pas manipuler l'appareil avec les mains humides
Ne pas exposer l'appareil à l'eau ou un fort taux d'humidité
Ne pas exposer l'appareil directement au soleil ou aux lumières fortes
Ne pas exposer la machine au feu ou à de fortes sources de chaleur
Ne pas exposer exposer la machine à des gaz corrosifs ou de fort champs magnétiques
Ne pas exposer la machine à la poussière
Ne pas cogner ou déplacer l'appareil lors de son fonctionnement
Ne pas mettre ses mains ou un quelconque objet dans la cuve de migration lors du fonctionnement de la machine
Ne pas débrancher la cuve lorsqu'elle est allumée
#### Matériel
#### Mode d'emploi
##### 1. Couler les gels
La première étape consiste à couler les gels dont vous aurez besoin pour effectuer votre migration. Ce kit permettant d'effectuer des migration d'extraits d'acide nucléiques; les gels coulés sont donc uniquement des gels d'agarose, coulés à l'horizontal. Selon le pourcentage d'agarose du gel, celui-ci retiendra plus ou moins les petits fragments de matériel génétique. Un gel à 0.5% d'agarose permet ainsi l'analyse de fragments compris entre 30 000 et 1000 paires de bases, tandis qu'un gel à 2% d'agarose permet plutôt l'analyse de fragments de 2000 à 50 paires de bases. En fonction de vos fragments, vous pouvez donc choisir le bon pourcentage d'agarose.
Selon le nombre d'échantillons à faire migrer, vous pouvez choisir les peignes à 12 ou 22 dents; de même, selon la durée de vote électrophorèse ou sa résolution, vous pouvez couler votre gel dans les petites plaques (10.5x6 cm) ou la grande plaque (10.5x10 cm), et placer le diviseur de plaques amovible dans la fente correspondante.
- Placer le support de coulée de gel sur une surface plane et rajouter le séparateur de manière approprié afin d'éviter des fuites. On peut le placer dans l'encoche centrale si on veut deux petites plaques de gel ou dans une encoche latérale si on veut une grande plaque de gel.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/separateur.jpg)
- Déposer un des plateau transparent selon la quantité de gel à couler.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/cuves.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/cuve.jpg)
- Placer le peigne sur la plaque. Si on utilise le peigne à 22 dents veiller à ce que l'encoche des dents soit tournée vers la direction opposée à celle de la migration.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/peigne.jpg)
- Mixer et chauffer la solution d'agarose pour en faire un gel (prévoir 25mL de gel). Laisser le refroidir jusqu'à 60°C.
- Verser le gel sur le plateau de manière à former approximativement une couche de 4mm d'épaisseur et attendre environ 20 min que le gel se solidifie.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/gelatine.jpg)
- Soulever délicatement le peigne pour le retirer. Les petits trous formés par le peignes doivent restés propres et nets.
- Retirez délicatement la plaque de gel avec le gel du support et la placez le dans la cuve de migration dans la bonne direction (les échantillons d'ADN migrent du – vers le +).
##### 2. Préparation du réservoir
Assurez-vous que la machine soit bien installée sur une surface plane!
- Déposer le plateau contenant le gel au centre de la plaque transparente. Si vous avez choisi le grand plateau, il devrait recouvrir l'entièreté de la plaque transparente. Si vous avez choisi le petit plateau, des petites encoches vous aideront à correctement le placer.
- Verser délicatement une solution tampon appropriée d'une épaisseur de 2 mm au dessus de la surface du gel (~200 mL).
D'après le constructeur, il est recommandé d'utiliser du TAE ou du TBE avec une concentration de 0.5
- Brancher l'alimentation au réservoir de migration.
##### 3. Ajout des échantillons d'ADN au gel
- Utiliser une pipette appropriée pour disperser des échantillons dans l'épaisseur du gel. (La solution tampon doit être mixée aux échantillons d'ADN pour qu'ils coulent au fond du puits)
- Descendre avec précaution le couvercle de sûreté. Le filtre orange doit être en parfait contact avec la solution tampon de façon à ce qu'il n'y ait pas de bulles. Si le niveau de la solution est trop bas, retirer le couvercle et ajouter plus de solution tampon.
- Glisser la lampe LED bleue sous le bassin à gel.
##### 4. Lancement de l'électrophorèse
- Brancher le générateur ET la lampe LED.
- Presser ▲▼ pour définir le temps de fonctionnement de la machine. Pour faire fonctionner la machine en continu, mettre le temps à ''00''. Sélectionner la tension sortante appropriée.
- Lancer l'opération avec le bouton RUN/STOP. La LED indiquant la tension sortante clignotera pour indiquer qu'une opération est en cours. Pour indiquer la fin d'une opération, l'alarme sonne 3 fois et l'écran affiche Ed pour END.
(Il suffit d'appuyer sur une touche quelconque pour faire disparaître « ED » et lancer une nouvelle opération).
- Pour stopper une opération en cours, appuyer sur RUN/STOP pendant 3 sec. La LED de voltage s’arrêtera de clignoter.
- Pour retirer le gel à la fin d'une électrophorèse, éteindre la machine et retirer le couvercle et le plateau de gel.
##### 5. Visualisation de l'électrophorèse en cours
- Allumer la lampe LED grâce au bouton ON/OFF
- Il peut être nécessaire de diminuer ou éteindre la lumière ambiante, pour de meilleurs résultats.
- La lumière s'éteindra automatiquement après 5 minutes.
##### 6. Photographie du processus en utilisant un smartphone
- Pour prendre une photographie avec son téléphone, mettre le cache photographique sur le couvercle.
- Insérer le filtre orange sur la plate-forme supérieure et aligner la caméra du téléphone avec le filtre.
- Zoomer et faire la focale si nécessaire pour optimiser l'image et prendre des photos.
# Four Zetasinter
Le four Zetasinter permet de fritter les objets imprimés en 3D avec les filaments de la marque Nanoé, pour obtenir des objets en céramique ou en métal.
# Confection des objets de référence
Le déliantage et le traitement thermique sont annoncés comme causant une contraction de l'objet imprimé à la fois reproductibles et isométrique.
Il est important de le vérifier et mesurer ce facteur de contraction.
Le mieux est probablement de repartir de l'idée du cube aux faces marquées X-Y-Z, et de le produire de plusieurs tailles, pour obtenir une abaque contraction/taille. Mais la chambre est cylindrique, et tous les objets n'auront pas une enveloppe cubique. Il semble donc utile de prévoir également un objet de référence allongé.
# Mise en route
Opérations réalisées par C. Simon, 22/11/2023.
Dès la mise en route, en branchant le four, on entend une turbine qui se met en action.
Un voyant vert "Power" s'allume en façade, mais le contrôleur de température reste éteint. Il faut basculer l'interrupteur "Lock" pour pouvoir enclencher l'alimentation du contrôleur.
Les documentations originales de Nanoé sont ici :
[zetasinter tubular operation manual.pdf](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/446)
La documentation n'est pas difficile à suivre, et il est inutile de la reprendre ici. C'est à peine plus compliqué qu'un programmateur de four domestique.
La première mise en fonction nécessite un traitement de la chambre à 300°C pour 2h.
Le programme de chauffe est indiqué dans la notice : je crois comprendre que la montée va durer 85 min (période t01).
On observe le chauffage progressif, par impulsions inférieures à 1s de 80 à 90A sous 20V, la ligne de base du courant s'élevant progressivement (20-30 A sous 10V lorsqu'on atteint 85°C par exemple). Chaque impulsion provoque des vibrations audibles (au niveau de la turbine pré-citée ?).
A 90°C, l'ensemble de la carcasse est restée froide. L'ensemble des éléments métalliques accessibles (gainage du tube, bouchons) restent froids. Le dessus du four est également à température ambiante, sauf peut-être au centre (circulation d'air ?)
A 150°C, la grille qui ceint le tube tiédit, du côté droit uniquement. Le côté gauche reste à température ambiante (pourquoi ?).
Après 30 min à 300°C, on prend les clichés suivants :
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/iri-20231122-200623.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/iri-20231122-200606.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/iri-20231122-200555.jpg)
(images prises avec une caméra PC210 Guide-IR de la plateforme de physique. La plage de mesure est limitée à 550°C)
On voit que la grille monte plus haut à droite qu'à gauche, mais reste non-brûlante. Le cordon d'alimentation électrique étant moins sollicité, sa température se stabilise autour de 30°C.
Ultérieureument, lors de la baisse de température, une nouvelle prise montre que la grille de droite est montée à 80°C, ce qui peut présenter un risque de brûlure. Il faudra donc prévoir une signalétique appropriée.
La différence de température droite/gauche s'explique peut-être par le fait que l'introduction du gaz de balayage est censé se faire par la droite. **A vérifier**.
La première montée à haute température (au-delà de 400°C) nécessitera une passivation des éléments chauffants, en montant à 1200°C pour 2h. Elle est prévue pour le lendemain, 23/11. Ce sera également l'occasion de tester certains paramètres de qualité de l'air.
# Humidimètre
Appareil à dessication forcée permettant la détermination des concentrations en eau par pesée.
# Dessiccateur MB23 - OHAUS
### Mode d'emploi du dessiccateur MB23 :
Cette machine détermine le taux d'humidité de l'échantillon donné en fonction de sa perte de poids lors de son séchage par réchauffement.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-02/dessiccateur-mb23-702427-1-7b20.webp)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-02/dessiccateur-mb23-702427-2-4fb2.webp)
**!! Vidéo explicative de 2 mins pour bien utiliser la machine :** [**https://youtu.be/01EYK0ypvTo?si=5Yrel350pfWEViba**](https://youtu.be/01EYK0ypvTo?si=5Yrel350pfWEViba)
#### Consigne
Port de gants, blouses de chimie, lunettes de sécurité et masques respiratoire est nécessaire lors de l'utilisation de la machine
Évitez les espaces avec des changements de température ou de fortes températures, un fort taux d'humidité, des courants d'air, des vibrations ou de champs électromagnétiques lors de l'utilisation de la machine.
**Certains échantillons demandent des soins spéciaux !!!** Dans ces cas là ne laissez pas la machine sans surveillance
- **Incendie ou explosion** : Substances contenant des solvants ou des vapeurs explosives ou inflammables en cas de chauffement !! Avec ce type d'échantillons travaillez à des températures de séchage suffisamment basses pour éviter la formation de flammes ou d'explosion.
- **Empoisonnement ou brûlure** : Les substances contenant des composants toxiques ou caustiques doivent être séchées uniquement dans une hotte.
- **Corrosif** : Les substances dégageant des vapeurs corrosives une fois chauffées doivent être testées en petites quantités
L'échantillon à mesurer doit être supérieur à 0,5g ! (**>0,5g**)
#### Opération :
Commandes :
Installation
1. Installez le pare-vent de forme cylindrique au fond de la machine
2. Installez le support du plateau par dessus. Le tournez jusqu'à ce qu'il s'enfonce bien
Branchez la machine si possible 15 min avant son utilisation.
Un plateau d'échantillon amovible est à disposition pour les mesures.
**Mode de fonctionnement : **
- **Mesure du taux d'humidité d'un échantillon**
1. Allumez la machine
- Un appui long sur le bouton Marche/Arrêt l'éteindra
- Un appui court la mettra en veuille
2. Placez un plateau d'échantillon vide sur le support de plateau et tarez la balance (bouton →T←). Le poids qui s'affiche sur l'écran est nul.
3. Retirez le plateau d'échantillon. Répartissez l'échantillon de manière uniforme sur le plateau et le replacer. L'échantillon doit être supérieur à 0,5g ! (!!Pensez à faire un test d’essai....se référer a la fin de la page!!)
- **Mode d'édition de la température**
1. Temps : appuyez rapidement pour le réglage de température
2. Régler : pour augmenter ou diminuer la valeur de la température
3. Tare : appuyez longuement pour valider la nouvelle valeur et revenir sur le mode de pesée
(Attention !! après 5s d'inactivité la valeur est enregistré et passe en mode de pesée)
- **Mode d'édition de la durée**
Ce paramètre peut-être réglé sur une duré spécifique ou sur AUTO (le test prend fin lorsque l'Analyseur détecte la fin de perte de poids)
1. Appuyez rapidement sur le bouton de durée pour activer le réglage du temps
2. Appuyez rapidement sur le bouton de durée pour pour permuter entre AUTO et une valeur de durée spécifique
3. Appuyez sur tare (→T←) pour valider le mode choisi
Il n'y a rien d'autre à faire si le mode AUTO a été choisi
Sinon :
1. Utiliser les boutons ▲▼ pour régler le temps de séchage
2. Appuyez rapidement sur tare pour valider le temps choisi
(Appuyez rapidement sur le bouton démarrer pour ne pas enregistrer les modifications)
- **Mode d'exécution**
1. Marche/Arrêt : appuyez rapidement pour exécuter
2. %g : pour changer d'unité si besoin (poids, humidité ou solide)
3. Si besoin, appuyez sur arrêt pour interrompre le test
4. Cliquer sur imprimer pour envoyer la valeur afficher au RS232
A la fin du test l'affichage clignote le résultat
- **Préparer un test d'essai :**
1. Régler la température à 120°
2. Durée =AUTO
3. Échantillon 3g d'eau
4. Placer un tampon en fibre de verre sur le plateau test
5. Appuyer Tare pour mettre à 0
6. Ajouter les 3g d'eau au tampon fibre
7. Appuyer sur démarrer pour lancer le test
Le résultat parfait doit être : 0g 100% d'humidité et 0% de solide
##### Optimisation du test :
La qualité des mesures obtenues reposent sur différents paramètres. Il est donc recommandé de **faire plusieurs essais en variant ces paramètres** pour déterminer leur configuration optimale :
- température de séchage
- durée de séchage
- poids de l'échantillon
- préparation de l'échantillon
- type d'échantillon
- **Température**
Sélectionnez une température de séchage qui **ne décompose ni ne change la structure chimique** de l'échantillon. (Mais une température basse prolonge inutilement le temps de séchage).
Certains échantillons peuvent donner divers taux d'humidité pour différentes températures. Les écarts peuvent être compensés en changeant la température de séchage.
- **Durée**
Le test doit avoir une durée de plus de 30 secondes pour être valide.
La durée de séchage peut-être établie :
- Manuellement en appuyant sur le bouton stop
- Automatiquement (lorsque la machine détecte une perte de poids <1mg en 60 sec)
- Par durée limitée avec un temps de séchage préréglé
- **Poids de l'échantillon**
Pensez à la durée de la mesure et la reproductibilité des résultats lors du choix du poids. (Plus c'est lourd moins c'est rapide, plus c'est léger moins c'est précis)
Valeurs recommandées : **3g ~< échantillon ~< 20g**
Un tableau pour vous aider à choisir :
**Poids de l'échantillon**
| **Reproductibilité**
|
0,5 g
| ±
1,0 %
|
1 g
| ±
0,6 %
|
2 g
| ±
0,3 %
|
5 g
| ±
0,12 %
|
10 g
| ±
0,06 % |
- **Préparation de l'échantillon**
Les différents échantillons doivent êtres uniformes et représentatifs de la quantité totale. La couche de l'échantillon sur le plateau de test doit être une couche mince et uniforme.
- **Types d'échantillons**
En cas de doute sur la dangerosité d'une substance, exécutez toujours une analyse détaillée des risques et ne laissez pas la machine sans surveillance.
Substances volatiles !! :
- Une **application rapide** de l'échantillon sur le plateau test est recommandée afin de limiter l'évaporation de l'humidité.
Substances empoisonnées et toxiques !! :
- Ces substances doivent être séchées uniquement **DANS UNE HOTTE !!**
Substances corrosives !! :
- Les substances dégageant des vapeurs corrosives une fois chauffées, comme les acides, doivent être testées **EN PETITES QUANTITÉS !!**
Substances poisseuses contenant de la graisse et fondantes :
- Utilisez un **filtre en fibre de verre** pour augmenter la surface de ces échantillons.
Substances liquides :
- Un **filtre en fibre de verre** permettra de repartir le liquide sur une surface plus grande.
Substances sensibles à la température et formant une peau :
- Un **filtre en fibre de verre couvrant l'échantillon** permet un chauffage plus doux et avantageux.
Substances contenant du sucre :
- Assurez vous que la couche appliquée est fine et uniforme et que la **température sélectionnée est moyenne**. Un filtre en fibre de verre peut aussi être utilisé.
# Incubateur
# Utilisation de l'incubateur
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-13.jpg)
##### **Liste des tâches:**
1\. Nettoyer et désinfecter les parois intérieures par précaution.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-1.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-2.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-3.jpg)
2\. Appuyer sur l'interrupteur, la température interne actuelle s’affiche au bout de quelques secondes.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-4.jpg)
3\. Appuyer sur FKT pour entrer dans le menu de configuration.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-6.jpg)
4\. Après 60 sec sans presser de bouton l’écran retournera à l’affichage de la température interne.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-7.jpg)
5\. L’écran affiche par alternance le paramètre et sa valeur. Changer la valeur du paramètre avec les flèches, changer de paramètre et valider le changement de valeur en appuyant de nouveau sur FKT 3 paramètres : "Set Point (SP)" de 0 à 70°C, "Timer Unit (t.Un)" minutes ou heures, "Timer Initial Value (t.st)" de 0 à 999 min ou de 0.0 à 99.9 hr , "t.of" signifie que le timer n’est pas actif.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-9.jpg)
6\. Appuyer sur "Time" pour lancer le timer , le timer n’attend pas que la température demandée soit atteinte, l’incubateur chauffe lentement il faut donc l’allumer longtemps à l’avance pour l’amener à la température d’utilisation et pouvoir utiliser le timer de manière effective.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/incubateur-10.jpg)
7\. Attendre que l’incubateur ait atteint la température demandée avant d’y insérer les échantillons.
8\. Après utilisation débrancher l’incubateur et nettoyer les parois internes à l’éthanol pour la prochaine utilisation
# Incubateur BRE240
Enceinte thermostatée qui permet le maintien de condition optimale pour les milieux de culture
# Fiche technique “Incubateur BRE240”
*Incubateurs de laboratoire précis et durables à convection naturelle ou forcée.*
Volume net : 230 L
Plage de régulation : 0°C à 100°C \*
Chauffage par convection assurée par un ventilateur (ni conduction ni de rayonnement)
Puissance : 2400 W
Dimensions extérieures (H x L x P) : 1500 x 626 x 679.5 mm
Dimensions intérieures (H x L x P) : 980 x 500 x 456 mm
***Pré-requis :***
\- Avoir un tourne-vis plat (cela servira pour régler le thermostat de sécurité)
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/7IJimage.png)
SV = température voulu
PV= température actuelle
**Consigne d’utilisation :**
\- **Allumer l’appareil :** Appuyer sur le bouton “Marche/Arrêt”
\- **Choisir la température de l’appareil** : Entrer la température de l’appareil dans le “Régulateur de température” à l’aide des touches S2 (flèche du haut) et S3 (flèche du bas)
*(Attendre que la température se stabilise, il faut environ 8 minutes pour monter à 60°C depuis la température ambiante)*
\- **Régler le thermostat de sécurité :**
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/c1Cimage.png)**LE THERMOSTAT DOIT ÊTRE AJUSTÉ À CHAQUE MODIFICATION DE TEMPÉRATURE !!**
1\. Retirer **le bouchon noir du bandeau de pupitre** pour accéder au thermostat de sécurité.
2\. Régler le thermostat de sécurité à **sa température maximum à l’aide d’un tournevis plat** (tourner vers la droite).
3\. Laisser l’incubateur se stabiliser parfaitement à la température de consigne.
4\. **Tourner le thermostat vers la gauche** jusqu’à entendre un déclic (le voyant rouge en façade s’allume).
5\. **Remonter très légèrement vers la droite** jusqu’à entendre le déclic (le voyant rouge s’éteint).
6\. Repositionner le bouchon noir. > La sécurité est opérationnelle.
**Clapet de ventilation:**
En fonction des applications, il peut être intéressant de régler l‘ouverture de la sortie d’air située à l’arrière de l’appareil. Ce réglage se fait à l’aide du bouton situé sur le panneau de commande de l’incubateur.
\---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**Les ALARMES !!!**
\- **Alarme visuelle haute et basse :** On définit un seuil de sécurité bas et un seuil de sécurité haut. Si la température
mesurée franchit ces seuils, l’alarme se déclenche et le voyant rouge (à l’avant de l’incubateur / à côté du thermostat) s’allume
(Les valeurs d’usine sont : Seuil bas = 0°C / Seuil haut = 100°C)

*On peut également modifier le seuil des alarmes haut et bas.*
*Pour cela, on passe par le régulateur de température*
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/XNoimage.png)
**Réglage de l’alarme basse :**
1\. Afficher le bloc de paramètres n°1 en appuyant sur SEL pendant 1 sec.
2\. Afficher le paramètre (A2-L), à l’aide des touches “S2” et “S3” et sélectionner en appuyant sur SEL.
3\. Modifier le paramètre (A2-L), à l’aide des touches “S2” et “S3”
4\. Valider en appuyant sur SEL
**Réglage de l’alarme haute :**
1\. Afficher le bloc de paramètres n°1 en appuyant sur SEL pendant 1 sec.
2\. Afficher le paramètre (A2-H), à l’aide des touches “S2” et “S3”, sélectionner en appuyant sur SEL.
3\. Modifier le paramètre (A2-H), à l’aide des touches “S2” et “S3”
4\. Valider en appuyant sur SEL.
*Il est aussi possible de temporiser ces alarmes, c'est-à-dire de définir une durée, l’alarme se*
*déclenche si la température mesurée atteint ou dépasse le seuil pendant la durée définie.*
*Cette valeur est réglée en usine à 0 sec. Par défaut, l’alarme est donc active dès que la*
*valeur d’alarme haute est atteinte.*
**Temporisation de l’alarme basse :**
1\. Afficher le bloc de paramètres n°3 en appuyant sur SEL pendant 5 sec.
2\. Afficher le paramètre dLy2, à l’aide des touchesC(S2) et D(S3) et sélectionner en appuyant sur SEL.
3\. Modifier le paramètre dLy2, à l’aide des touchesC(S2) et D(S3)
4\. Valider en appuyant sur SEL.
**Temporisation de l’alarme haute :**
1\. Afficher le bloc de paramètres n°3 en appuyant sur SEL pendant 5 sec.
2\. Afficher le paramètre dLy2, à l’aide des touches C(S2) et D(S3) ) et sélectionner en appuyant sur SEL.
3\. Modifier le paramètre dLy2, à l’aide des touches C(S2) et D(S3)
4\. Valider en appuyant sur SEL
*En plus du thermostat de sécurité, il y a un fusible thermique qui protège de toute*
*surchauffe. Sa température de coupure est de 190°C*
*[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/eMcimage.png)!! Attention aux surfaces chaudes à l’arrière de la machine sur le couvercle supérieur !](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/Nhuimage.png)*
\---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**Petit descriptif des paramètres :**
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/TwTimage.png)
1\. Sélectionner le bloc de paramètre adapté en appuyant 1,3 ou 5 sec. sur la touche SEL.
2\. Sélectionner le paramètre à modifier en appuyant sur les touches S2 et S3
3\. Valider le paramètre en appuyant sur la touche SEL (après validation, le paramètre modifié clignote).
4\. Modifier la valeur du paramètre en appuyant sur les touches S2 et S3
5\. Appuyer sur la touche SEL pour enregistrer cette valeur.
6\. Retourner en mode opérateur en appuyant sur la touche SEL pendant 2 secondes.
**Les Fonctions programmables :**
\- Fonction **rampe** : Permet de programmer la vitesse de montée en température de l’incubateur puis de maintenir la température de l’enceinte à la température de consigne pour une durée maximale de 99 h 59 min (par segment de programmation)1
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/ftOimage.png)
=> Pour **sélectionner les paramètres** : Appuyer sur SEL pendant 3s. Afficher “Su-I” en utilisant les touches “S2” et “S3” puis valider (SEL). Choisir la température de consigne en utilisant les touches “S2” et “S3” puis valider (SEL). Répéter l’opération pour les autres paramètres.
\- **Arrêt programmé** : Permet de stopper automatiquement le chauffage de l’enceinte à l’issue d’un temps déterminée, à partir de la mise en route.2
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/jnbimage.png)
*1. Pour redémarrer l’incubateur, utiliser soit le bouton “Marche/Arrêt” soit la fonction “RUN”*
*2. Pareil…*
# PHmètre
# Utilisation de la PHmètre
##### **Présentation de la machine**
Le pH mètre est un système composé d’une électrode SI Analytics pH relié au boîtier Lab 850.Ce système permet de faire des mesures de pH précises au millième. La calibration est nécessaire, et doit se faire de régulièrement à très régulièrement en fonction de la fréquence d’utilisation.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/img-0880.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/img-0837.jpg)
##### **Informations importantes**
- Ne **pas essuyer la sonde avec du papier**, la rincer à l’eau distillée en utilisant une pissette et un bécher est suffisant.
- Ne **pas utiliser la sonde comme agitateur** et ne pas l’agiter de n’importe quelle manière qui soit
- Avant d’enlever ou de remettre le Capuchon de trempage, **ouvrir le petit clapet obturant le trou de remplissage et le refermer après**.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/img-0834.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/img-0835.jpg)
- Du **liquide intérieur de la sonde doit toujours arriver au moins au niveau du diaphragme** dans la sonde.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/img-0836.jpg)
- Ne **pas manier la sonde manuellement** mais utiliser la potence pour la bouger.
- La **calibration doit s'effectuer rapidement**, donc ne pas traîner, surtout pendant la phase de rinçage de la sonde entre les différents tampons.
##### **Calibration**
Le boîtier allumé et la sonde dans son capuchon protecteur, le calibrage peut s’effectuer. Lors du calibrage, l’ordre des tampons (BUFFER 1, 2 et 3) n’est pas réellement important puisque l’appareil les reconnaît, mais il est préférable de les utiliser dans l’ordre de pH croissant. Par défaut, l’appareil a enregistré le set de buffer DIN Si Analytics GmbH, composé de buffers à pH4,006 6,865 et 9,180. Si besoin est de changer ce set, se référer à la notice.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/img-0841.jpg)
\- Appuyer sur <CAL>
Le numéro de set de tampon s’affiche et l’appareil demande le buffer1 (tampon1)
\- Régler la température du buffer1 avec les flèches (en général la même que la température ambiante, sauf cas ou les tampons auraient été placé dans une zone de température différente.)

\- Enlever le capuchon de trempage de la sonde, **CONSERVER PRÉCIEUSEMENT LE CAPUCHON ET LE LIQUIDE QU’IL CONTIENT**.
\- Rincer la sonde à l’eau distillée en utilisant une pissette et un bécher.
\- Mettre la sonde dans le tube contenant le buffer 1.
\- Appuyer sur <OK>.
\- Attendre que le pH se stabilise.
L’appareil bipe et vous demande maintenant le BUFFER 2.
\- Enlever la sonde du buffer 1.
\- Rincer la sonde à l’eau distillée en utilisant la pissette et un bécher.
\- Régler la température du buffer 2 (normalement identique au buffer 1).
\- Plonger la sonde dans le tube contenant le buffer2.
\- Appuyer sur <OK>.
\- Attendre que le pH se stabilise.
L’appareil bipe et vous demande maintenant le BUFFER 3.
\- Enlever la sonde du buffer 2.
\- Rincer la sonde à l’eau distillée en utilisant la pissette et un bécher.
\- Régler la température du buffer3 (normalement identique au buffer 1 et 2).
\- Plonger la sonde dans le tube contenant le buffer3.
\- Appuyer sur <OK>.
\- Attendre que le pH se stabilise.
L’appareil bipe, il affiche pendant 10 secondes la valeur ASY puis celle de SLO pendant 10 autres secondes. Il retourne ensuite en mode "Mesure". Le calibrage est **terminé**.
\- Enlever la sonde du buffer 3.
\- Rincer la sonde à l’eau distillée en utilisant la pissette et un bécher.
\- Remettre la sonde dans son capuchon protecteur en pinçant légèrement le capuchon de trempage, ou bien commencer les mesures.
##### **Entretien**
\- Le capuchon de trempage et la sonde contiennent du liquide KCl 3mol/L. Entre les utilisations, l’extrémité de la sonde (diaphragme) doit toujours tremper dans le liquide KCl du capuchon.
\- Pour enlever les traces et d’éventuels encrassements sur la sonde et sur le diaphragme, l’utilisation de solvants adaptés est nécessaire : acides minéraux (HCl dilué par exemple) pour les dépôts calcaires, solvants appropriés pour les encrassements organiques, et solutions tensioactives pour les graisses déposées.
\- Des solutions tampons sont en stock sous forme d’ampoules de verre, chaque ampoule permettant de remplir 2 tubes tampons.
##### **"Monsieur, je n'arrive pas à calibrer !"**
**Err1** s'affiche sur la console
- Vérifier que le diaphragme de l'électrode est recouvert de KCl et qu'il n' y a pas de bulles d'air sur celui-ci.
- Vérifier que l'électrode est correctement branchée et qu'il n'y a pas de problème avec son câble.
**Err2** s'affiche sur la console
- Vérifier le raccord entre l'électrode et le boiter : recommencer la calibration.
- Vemps de calibration trop long : recommencer en prenant moins son temps.
**Err4** s'affiche sur la console
- Température instable pendant la calibration : recommencer la calibration en conditions de température constantes.
**CalError** s'affiche sur la console
- Valeurs déterminées hors des limites admises : calibrer à nouveau.
- Vérifier l'état du diaphragme : si besoin le nettoyer.
- Electrode cassée : vaut mieux pas, essayer de nouveau.
# Phytotron
Paramétrages et utilisation d'un incubateur dédié aux végétaux
# Création de programme (logiciel AtmoCONTROL)
**[Manuel du logiciel](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/wiki/lib/exe/fetch.php?media=wiki:tutoriel:ba-atmocontrol-fr-d24130.pdf) / [Software manual](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/wiki/lib/exe/fetch.php?media=wiki:tutoriel:atmocontrol-en-v2.4.pdf)**
Lancer le logiciel Atmocontrol, et connecter la clé USB du phytotron à l’ordinateur.
Si l’appareil IPP 260 plus n’apparaît pas dans la colonne de gauche, aller dans le menu “Device” puis choisissez l’option “Connect offline from USB device” et sélectionnez l’option “V6160109”.
Dans la partie supérieure droite de l’écran se trouve les trois onglets : “Editor”, “Simulation” et “Protocol”.
Sélectionnez l’onglet “Editor”. Dans la fenêtre, on retrouve maintenant une barre grise avec à sa gauche une icône d’un thermomètre. Sur la partie gauche de la barre, il y a un rectangle plus foncé, c’est ici que vous mettrez les différents modules pour contrôler les paramètres.
Avec ce programme, vous pouvez modifier la température et l’éclairage du phytotron.
- Dans la partie gauche de l’écran d’édition, on retrouve 8 icônes qui permettent de :
- Modifier la température de façon linéaire (de 10 à 50°C). La température de départ sera la dernière température définie, et si aucune température n’a été définie avant la température par défaut sera 20°C.
- De garder la chambre d’incubation à une température constante (de 10 à 50°C)
- De modifier la luminosité (0% à 100% de luminosité)
- De jouer une alarme lorsque le programme arrive à une certaine étape jusqu’à ce que l’utilisateur appuie sur le bouton principal du phytotron pour stopper l’alarme
- De définir les jours de la semaine pendant lesquels le programme doit être exécuté
- De régler la date de lancement du programme
- De répéter une séquence du programme pendant X fois
- De mettre les systèmes du phytotron à l’arrêt
- De changer la provenance de l'air introduit dans le phytotron (provenant d'une filtration de l'air environnant ou d'une bonbonne de gaz particulière).
Pour insérer un item dans le programme, il suffit de le sélectionner et de le faire glisser dans le rectangle gris en maintenant le clic gauche. Pour supprimer un item du programme, on le fait glisser en maintenant le clic gauche vers la corbeille.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/img-3.jpg)
On attribuera une durée, allant d’une minute à une durée infinie, pour les items contrôlant la température. Cependant, l’attribution d’une durée à l’item contrôlant la luminosité est impossible. La valeur de la luminosité restera fixe jusqu’à ce qu’elle soit à nouveau modifiée dans le programme.
**Remarque:** Vérifier que tous les items soient dans le même bloc.
Une fois votre programme terminé sauvegardez votre fichier dans le dossier Memmert/profiles sur la clé USB.
# Lancement d'un programme AtmoCONTROL
#### Objectifs
Après avoir préparé le Phytotron, et exporté le programme AtmoCONTROL sur la clé USB, il faut maintenant mettre le programme en marche dans le Phytotron.
#### Interface
⚠️ Les écrans des différents menus ne sont pas tactiles.
Pour sélectionner un menu, cliquer sur le bouton tactile à côté puis, pour y naviguer, utiliser le bouton de sélection.
Pour revenir au menu précédent, cliquer sur le bouton tactile du menu dans lequel vous naviguez.
En cas de doute, le bouton \[MENU\], qui est tactile, vous permet d'accéder aux différents paramètres et réglages.
#### Exportation du programme d'une expérience
##### Étape 1
Allumer le phytotron, si ce n'est pas déjà fait.
##### Étape 2
Insérer la clé USB portant le programme AtmoCONTROL dans le port USB sur le côté droit de l'interface.
##### Étape 3
Cliquer sur le bouton \[MENU\] pour accéder aux différents paramètres de la machine.
##### Étape 4
Sélectionner le menu PROTOCOLE grâce au bouton tactile sur la gauche.
##### Étape 5
Le menu s'ouvre en affichant le programme en cours, et deux options : sélectionner ou supprimer. Pour changer de programme, sélectionner supprimer avec bouton de sélection puis valider.
##### Étape 6
Les différents programmes compris dans le phytotron et dans la clé USB s'affiche, il suffit de trouver votre programme dans la liste et de valider.
⚠️ Vous êtes directement redirigé à l'écran précédent, mais n'ayez craintes votre programme a bien été sélectionné.
##### Étape 7
Le programme ayant été choisi, il ne vous reste plus qu'à le lancer. Cela se fait dans l'autre interface de menu, celle avec les informations de vos cycles en cours. Pour y accéder, appuyer à nouveau sur le bouton \[MENU\].
Une fois dans ce menu, sélectionner le menu de lancement en haut à droite.
Il est possible de modifier les paramètres du phytotron sans arrêter les différentes manipulations en activant le mode manuel. Les différents menus de température, lumière et alarme deviennent alors accessibles et modifiables.
Si vous souhaitez arrêter l'expérience, il suffit d'appuyer sur le bouton ''arrêt''. Dans le cas où vous souhaiteriez ensuite relancer le phytotron, le programme recommence du début quand vous appuyez sur le bouton ''lecture''.
##### Quelques petits conseils et astuces supplémentaires :
- Il est possible de récupérer les données de votre expérience en cliquant sur le menu ''Protocole''. Les données du phytotron sur votre expérience seront ensuite copiées sur la clé USB branchée. Il sera ensuite possible d'y accéder sur un ordinateur grâce à un logiciel de traitement de texte (OpenOffice, Word).
- Pour y accéder, suivez le chemin : Memmert->Devices->le nom de votre phytotron->Protocols->l'année de votre expérience->le mois de votre expérience en nombre.
# Phytotron Memmert
Le Phytotron Memmert est une enceinte contrôlée spécifiquement conçue pour l'expérimentation végétale mais qui peut être détournée vers d'autres usages.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-10/th.jpg)
Les paramètres qui peuvent être contrôlés sont : la température, l'intensité lumineuse, la durée d'éclairement. Le tout adossé à un logiciel externe (AtmoControl) qui permet de réaliser des programmes complexes (cyclages variés avec variations graduelles ou rapide).
Constitution de l'appareil : une chambre avec porte isolante et contre porte transparente pour une observation sans perturbation importante des paramètres internes, contenant un système d'homogénéisation par ventilateurs arrières et cellules à effet pelettier, des rampes de leds latérales par niveaux, des étagères grillagées modulables. Un tableau de bord frontal sous forme d'un bloc de commande avec affichage et réglages.
Les boutons et l'affichage :
Utilisation de base de l'appareil : mise en marche par interrupteur du tableau de bord, choix du programme et mise en lecture
Programmation et extractions : les programmes réalisés via le logiciel externe AtmoControl peut-être importé via la clé usb spécifique à l'appareil (à droite du tableau de bord). Avant toute modification le programme en cours doit être mis en mode manuel. Parfois la programme n'apparait pas en premier lieu dans la liste, dans ce cas éteindre et rallumer l'appareil. Les fichier n'apparaissent pas par ordre alphabétique mais par date de création du plus ancien au plus récent, et de la mémoire interne de l'appareil avant celle de la clé usb (donc il faut chercher à la fin).
**Remarque:** En cas de coupure électrique, l'appareil redémarre automatiquement à la remise sous tension du réseau et reprend le programme en cours tout en indiquant l'évènement et sa durée dans le journal interne.
# Utilisation de la machine
\- Nettoyer et désinfecter les parois intérieures par précaution.
\- Appuyer sur le bouton On/Off pour allumer la machine : l’écran s’allume en affichant les conditions définies et actuelles.
\- Pour modifier les conditions voulues (température, luminosité et timer) il suffit d'appuyer sur le bouton à côté du paramètre, de modifier la valeur avec la molette (i.e bouton rotateur) et d'appuyer sur le bouton au centre de la molette pour valider.
\- Il est important de placer les échantillons de manière espacée et uniformes pour la libre circulation de l’air dans le caisson.
\- L’éclairage du caisson ne peut être actif qu’en dessous de 40°C.
\- L’élaboration de programme de variation de conditions se fait sur un logiciel à part qui doit ensuite être téléchargé dans le phytotron.
\- Après utilisation éteindre le phytotron et nettoyer les parois internes à l’éthanol 70° pour la prochaine utilisation.
# Roto-évaporateur
Appareil d'extraction des solvants.
# Evaporateur rotatif
#### Présentation de l'appareil
Cet appareil permet l'évaporation du solvant après une synthèse, grâce au principe de la distillation. Le solvant, étant en général plus volatil que le produit de synthèse, est facile à faire évaporer, en jouant sur la température et la pression. En effet, en abaissant la pression et en augmentant la température, on peut faire passer le solvant de l'état liquide à l'état gazeux.
L'évaporateur rotatif est composé de plusieurs parties:
- - - un bain thermostaté, afin d'être à température constante
- un réfrigérant pour liquéfier les vapeurs de solvant
- une pompe à vide pour abaisser la pression
- une entrée d'eau
- un ballon pour récupérer le solvant
- un moteur permettant la rotation du ballon contenant le produit en solution
*photo*
#### Mode d'emploi
Selon le solvant que l'on souhaite évaporer, il n'est pas forcément nécessaire de mettre en route la pompe à vide pour diminuer la pression. Dans le cas où on se met à faible pression, la température du bain-marie pourra être diminuée. Ainsi, pour faire évaporer notre solvant, on suit le protocole suivant:
- - - allumer le bain-marie et le régler à la température désirée
- ouvrir l'entrée d'eau pour le réfrigérant
- fixer le ballon avec le produit d'intérêt en solution (faire attention à ce que la taille du goulot du ballon et de l'appareil coordonnent)
- mettre en route la rotation du ballon
- allumer la pompe à vide
- fermer l'entrée d'air
- abaisser le ballon dans le bain-marie
Lorsque l'évaporation est terminée, on procède au même protocole dans le sens inverse:
- - - remonter le ballon du bain-marie
- ouvrir l'entrée d'air
- éteindre la pompe à vide
- arrêter la rotation du ballon
- détacher le ballon
- fermer l'entrée d'eau pour le réfrigérant
- éteindre le bain-marie
#### Précautions d'emploi
L'utilisation de l'évaporateur rotatif demande de faire attention à quelques points, dont la mise en ébullition du solvant qui peut faire entrer des gouttes dans le réfrigérant. Si le solvant venait à buller fortement de la sorte, on peut augmenter la vitesse de rotation du ballon ou contrôler manuellement la pression, en gardant une main sur l'entrée d'air. Il faut également faire attention à la verrerie utilisée car si celle-ci est endommagée, il peut avoir un risque de casse.
# Spectrophotomètres
# Spectrophotomètre IR
Spectromètre permettant de faire de l’analyse structurelle de molécule dans l'Infra-Rouge.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-03/image-1679049019718.jpg)
##### **1) Généralité :**
La spectroscopies d'absorption Infrarouge est une technique couramment utilisé en laboratoire.
Dans le proche IR, les liaisons entre deux atomes d'une molécules rentre en interaction avec le rayonnement IR. Cette interaction peu être mesuré et analysé par l'appareil. Les données sont tracés dans un graphe absorption (ou transmittance) en fonction du nombre d'onde. Certaines bandes (ou pics) sont caractéristique de liaisons spécifiques. L'image suivante regroupe les principales bandes caractéristiques en IR :
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-03/table-ir.jpg)
Pour aller plus loin, voici des exemples de lectures intéressantes :
*1. Interpretation of Infrared Spectra, A Parctical Approach, John Coates, Encyclopedia of analytical Chemistry, [https://doi.org/10.1002/9780470027318.a5606](https://doi.org/10.1002/9780470027318.a5606)*
*2. Analyse chimique, Méthodes et techniques instrumentales : Francis Rouessac et Annick Rouessac, Dunod, 9eme édition*
#####
##### **2) Utilisation du Spectromètre IR pour une analyse usuel :**
Dans cette exemple, nous allons réaliser un spectre IR d'un échantillon d'un solvant, l'acétone.
Pour commencer, vérifiez que l'appareil est allumé (voyant vert) bien branché en USB sur le pc.
Ouvrez le logiciel Perkin Helmer Spectrum IR. Entrez les login et password suivant lorsque la fenêtre de login s'ouvre :
login : fablabuser
password : fablabpass
Une fois le logiciel ouvert, vérifiez que l'appareil est bien connecté à l'ordinateur via la barre des tache en bas à droite.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-03/image-1679046373799.png)
Il est nécessaire d'effectuer un spectre de background. En effet, l'air environnant à une réponse importante dans l'IR : le spectre de référence sera soustrait du spectre de mesure automatiquement.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-03/image-1679049107399.png)
Préparez ensuite l'échantillon sur l'ATR.
Dans cette exemple, nous analysons un liquide non visqueux. Il n'est donc pas nécessaire d'utiliser la jauge de contrainte. Cependant celle-ci est indispensable lorsque l'on analyse des solides ou des liquides visqueux. Pour utiliser la jauge de contrainte, déposez l'échantillon sur l'ATR puis tournez la manivelle de tel sorte à ce que la tige descende et écrase l'échantillon. Il faut tourner la manivelle jusqu'à ce qu'un "clic" se fasse entendre.
Indiquez un nom de l'échantillon à analyser dans *Nom de l'échantillon* et si besoin, une description dans *Nom composé.*
Cliquez une première fois sur *Analyse* pour observer l'aperçu du spectre de l'échantillon. Cliquez une seconde fois sur *Analyse* pour réaliser le spectre définitif.
**Pensez à enregistrer le spectre sur la machine !!**
Il est possible de faire apparaitre les valeurs de nombres d'ondes pour chacun des pics du spectre. Pour cela, cliquez sur *Pics*.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-03/image-1679047802770.png)
# Spectrophotomètre UV-1605
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/spectro-uv-1605.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/spetro-uv-1605-02.jpg)
**Spectrophotomètre UV-1605 SHIMADZU**
Sur la photo de droite, on peut voir le compartiment où on place notre cuve d'échantillon à analyser (celui du devant) et la référence est placé derrière.
*N.B: Il faut faire attention à l'emplacement des cuves et le sens du faisceau lumineux. (Suivre les flèches sur la machine)*
##### **Liste des tâches**
**[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-162058.jpg)**
- Appuyer sur le bouton alimentation qui se trouve sur la gauche de la machine afin de la mettre en route
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-165021.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/VXx20171206-162203.jpg)
- Après la mise en route de la machine, attendre environ 5 minutes pour que cette dernière puisse faire la vérifications de certains paramètres. On sait que c'est bon lorsque toutes les étoiles sont blanches, comme sur la photo ci-dessus (à droite).
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-174834.jpg)
- Une fois le spectrophotomètre fonctionnel, la fenêtre ci-dessus apparait. Pour effectuer les réglages sûr les 4 anglets, du bas de la fenêtre en appuyant sur F1 , F42…
Par exemple sur F1 on change de l'absorbance vers la transmittance:
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-175725.jpg)
- En appuyant sur le bouton bleu “MODE”, on peut choisir ce que l'on veut faire avec le specto.
**Exemple:** Pour avoir le spectre d'Absorption on appuie sur le bouton “2”:
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-175734.jpg)
- Une seconde fois sur “2” pour changer la gamme de la longueur d'onde que le spectro va balayer et qui vous intéresse pour l'analyse: Avec le clavier numéroté pour pour entrer la longueur d'onde et “Entrer” pour sauvegarder la valeur.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-175739.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-175807.jpg)
- Une fois les réglages concernant l'analyse sont faits, appuyez sur le bouton “ START” pour lancer l'analyse:
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-175926.jpg)
- Un bip sera émit lorsque l'analyse sera terminée, et le spectre d’absorption apparaitra.
- On peut effectuer un“ZOOM” en appuyant sur “F1” ou faire apparaitre le tableau des valeurs d’absorbance avec “F2”
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-175954.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-02/20171206-180004.jpg)
# Spectrophotomètre UV-visible (Jenway)
Spectromètre à cuve permettant des mesures dans des liquides en spectre continu de l'UV-visible .
A savoir:
Il existe plusieurs types de cuve suivant l'échantillon.
La transmittance T est définie par : T = It,λ / I0,λ. On l’exprime en pourcentage.
L’absorbance A se calcule par : A = log(I0,λ / It,λ) = - logT. C’est une grandeur positive.
**Ici on va mesurer l’absorbance en fonction de différentes longueurs d'ondes en nanomètre.(ponctuel)**
**Aller dans le menu « Photometrics »**
1. Choisir ses paramètres de mesures : longueur d’onde (nm)
2. Faire la calibration avec le bouton "Blank"[ en utilisant la même longueur d’onde prévue pour la mesure (l’absorbance doit être à 0.00 et la transmittance à 100%)](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-04/jenway.JPG)
3. Insérer l’échantillon et exécuter la mesure avec la touche "sample"
**Il est également possible d’effectuer un spectre d’absorption en fonction de plusieurs longueurs d’ondes. (Continu)**
**Aller dans le menu « spectrum »**
1. choisir ses paramétrer de mesures: intervalle du spectre ( « » et la « fin » de la mesure souhaitée); la fréquence des mesures souhaitées
2. Faire la calibration avec « Blank » .
3. Insérer l’échantillon et exécuter avec « sample »
4. relever le spectre
# Teslamètre
Un appareil permettant de mesurer l’intensité du champs magnétique selon 2 axes
# Jeulin Bi-axiale
Permet la détection et la mesure de champs magnétiques de 0,1 mT à 100mT. ( champs crée par des courants de 2 à 10 A). Sa sonde bi-axiale mesure selon deux axes orthogonaux grâce à deux capteurs à effets de Hall.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-09/image.jpg)
Protocole :
- Brancher le cordon secteur
- Mettre l’interrupteur sur « Marche » (témoin allumé en rouge)
- Attendre que le témoin passe au vert pour la stabilisation thermique
- Sélectionner la commande magnétique à afficher ( bouton noir )
- sélectionner le calibre desiré ( bouton rouge)
- [la valeur affiché sur l’écran est en mT](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-09/img-2717.jpeg)
# Thermocycleur
Paramétrages et utilisation d'un appareil à PCR
# Guide d'utilisation du thermocycleur
# Fiche technique du thermocycleur XT⁹⁶
Le thermocycleur XT96 est un appareil qui permet d’effectuer de manière automatisée et séquentielle les cycles de température nécessaires pour effectuer la réaction en chaîne par polymérase (PCR) de l’amplification de l’ADN. Le thermocycleur fournit un environnement thermiquement contrôlé pour les échantillons PCR.
**Connectiques de l’appareil : **
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/S1nimage.png)
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/lo1image.png)
**Menu Principal : **
Le menu principal se compose de sept onglets. Chaque onglets contient un bouton d'aide pour une fonction d'aide directe.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/i57image.png)
**Comment utiliser le thermocycleur ? **
- **Le mode incubateur **
1. Appuyez sur 'incubate' dans le menu principal [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/RX2image.png)
2. Entrez la valeur de température du bol/couvercle et de temps souhaité[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/tnpimage.png)
3. Lancez l'incubation grâce à "run and stop" [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/iBzimage.png)[ ](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/iBzimage.png)
- **Lancement du mode simple dans l'onglet "Run"**
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/OCpimage.png)
1. Sélectionner un programme utilisé récemment ou créer votre propre programme avec le protocole Wizard (voir après)
2. vérifier les informations du programmes
3. Lancer avec le bouton start ( ou utiliser pour mettre sur pause)
4. Stopper avec le bouton stop
- **Modifier un programme**
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/rEaimage.png)
1. [ ](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/SLEimage.png)Entrer une nouvelle commande dans le programme existant
2. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/R5Wimage.png)Éditer une commande
3. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/V95image.png)Supprimer une commande
4. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/bWuimage.png)Sauver les modifications
5. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/rpximage.png)Sauver et lancer le programme
- **Protocole Wizard pour créer de nouveaux programmes[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/5uOimage.png)**
Ce protocole est un outil utile pour la création rapide et automatique de protocoles de PCR comme les programmes en 3 étapes, 2 étapes et le programme de gradient.
Un programme en trois étapes consiste en une étape séparée pour la dénaturation, l'amorçage et l'élongation.
Dans un programme en deux étapes, les étapes d'amorçage et d'élongation sont sont combinées en une seule étape.
Comment utiliser l'assistant en 3 étapes :[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/KWnimage.png)
1. 1. Saisir le nombre de cycles
2. Entrer la température de dénaturation (recommandation 95°C) et la durée (s)
3. Entrer la température de recuit de l'amorce de l'amorce.
Note : En général, la température de d'amorçage est d'environ 5°C en dessous de la moyenne calculée des paires d'amorces.
moyenne calculée de la température de fusion (Tm) de la paire d'amorces
4. Entrer la température d'élongation (72°C recommandée) et la durée.
Remarque : temps d'élongation (s) = longueur du produit \[bases\] / 1000 \[bases\] \* 60 s
Sauvegarder ou enregistrer et démarrer le nouveau protocole
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-11/ybMimage.png)
# Ultrasonic cleaner
Un nettoyeur ultrasonic est basé sur l’effet de cavitation causé par la vibration d’onde ultrasonique haute fréquence dans un liquide. Il permet de former des bulles microscopiques qui explosent violemment et « décapent » la surface d’un objet. Les bulles sont suffisamment petites pour pénétrer dans des surfaces poreuses et nettoyer en profondeur. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-09/tATimage.jpg)
Fonctionne entre 20-80°C
Temps d’utilisation 0-20min
Utilisation intensive à 40KHz
Pour l’utiliser :
- Placer la machine sur une surface plane et propre
- verifier que le ventilateur de refroidissement est intacte et adéquat
- verifier que toutes les commandes sont éteintes et que le robinet de vidange soit fermé
- Assurer vous que le fil d’alimentation soit bien branché et surtout pas en contacte avec l’humidité
- remplir de 7 cm environ le contenant avec un solvant
Types de nettoyage :
general : utilisez de l’eau et une temperature d’environ 50°C
Amélioré : vous pouvez utiliser du savon ou une autre solution de nettoyage **(non acide)**
Approfondi : Pour enlever le ternissement, le carbone et la rouille des métaux non plaqués, il est recommandé d’utiliser des solvants spécifiques au nettoyeur à ultrason.
**ATTENTION**
**ne pas faire fonctionner la machine plus d’une heure !**
matériaux possibles (listes non exhaustives) :
- Bijoux : Or, platine et argent
- piece de monnaie
- PCB Board
- piece de moteur
- composant électrique
- tète d’imprimante
- équipements chirurgicales
- couteaux
Non recommandés :
- perle, émeraude, tanzanite, malachite, turquoise, lapis, corail
**Protocole:**
1. Remplir le reservoir avec le solvant
2. mettre les elements dans le panier
3. brancher le fil d’alimentation
Pour l’utilisation ultrasonic :
1. faire pivoter le bouton « Timer » vers la gauche sur « ON » pour une utilisation continue sinon choisissez la durée du programme
2. Faire pivoter sur « OFF » pour éteindre
Pour une utilisation avec la température :
1. Choisissez une température ( en general les meilleurs temperatures de nettoyages sont entre 40 et 80°C)
2. Pivotez sur « OFF » pour éteindre la machine
Prenez vos elements et nettoyer la machine avec un chiffon sec en attendant le refroidissement
NE PAS VIDER L’EAU TANT QUE LA TEMPÉRATURE N’EST PAS REDESCENDU CELA ABÎMERAIT LA MACHINE !
# Réfractomètre
Zuzi modèle 325 - mesure de l'indice de réfraction d'un milieu
# Principe de fonctionnement et utilisations
Le réfractomètre est un appareil permettant de déterminer l'indice de réfraction d'une solution ou d'un solide. Cette mesure permet ensuite d'obtenir de nombreuses informations, comme par exemple, la concentration, la pureté ou encore les particularités optiques du milieu considéré.
Lorsque de la lumière passe dans un espace compris entre deux milieux différents (air et eau, liquide et solide, etc), celle-ci est divisée en deux rayons : un premier rayon est réfléchi, le second est dévié dans le second milieu. Ce rayon voit alors sa vitesse et son angle de réfraction modifiés. Ces deux modifications sont mesurées grâce à l'indice de réfraction. Chaque milieu en possède un qui lui est propre.
[Schéma de la réfraction de la lumière entre deux milieux](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/eivdw-schemasnelldescarte1-min.png)
L'indice de réfraction est calculé en fonction de la masse, de la charge et du nombre de particules dans le médium traversé par la lumière.
Cet appareil fonctionne donc selon un principe purement physique, et ne nécessite ainsi aucune alimentation électrique.
# Présentation
Le réfractomètre Zuzi, modèle 325 permet de mesurer des indices de réfraction de 1.3000 à 1.7000 nD, de 0 à 95% °Brix, avec une précision de ± 0.0005 nD et de ±0.25% °Brix. La mesure est possible pour un échantillon entre -50 et 70°C, et ne nécessite pas de source de lumière additionnelle.
Le réfractomètre est composé de nombreuses pièces :
Schéma des différents composants du réfracteur
# Etalonnage
Avant chaque utilisation, il faut calibrer le réfractomètre à l'aide de l'étalon fourni, un bloc solide avec son indice de réfraction indiqué à sa surface, et une solution de monobromide de naphtalène.
Voici le protocole d'étalonnage du Réfractomètre :
#### Sécurité et Installation :
1. Mettre gants, blouse et lunettes de protection (le monobromide de naphtalène est irritant pour les yeux et toxique quand ingéré)
2. Installer le réfractomètre sur un paillasse correctement éclairé afin d'avoir un éclairement optimal et obtenir une mesure parfaite
3. Ouvrir la partie supérieure du réfractomètre avec la mollette sur la gauche pour exposer le prisme
4. Prélever 2 gouttes de monobromide de naphtalène avec une pipette pasteur et les placer sur le prisme
5. Placer par dessus le solide fourni, indice de réfraction vers le haut
6. Refermer le prisme au maximum
Ne pas forcer pour fermer la partie supérieure du réfractomètre, dans ce cas-ci l'observation se réalise sans
[ ](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-02/img-0886.jpg)
Solide d'étalonnage Flacon de monobromide de naphtalène
#### Manipulation sur l'appareil :
1. En plaçant votre œil dans l’oculaire, vous observez normalement un cercle séparé en deux moitié, une claire et une sombre, ainsi qu'une échelle en dessous, l'échelle d’indice de réfraction
2. Régler la dispersion avec la mollette supérieure droite pour que la partie claire et la partie sombre soit séparées par une ligne nette
3. Régler l'indice de dispersion sur l'échelle sur celui indiqué sur l'étalon (nD=1.51663)
4. Si la ligne de démarcation entre les deux moitié, sombre et claire, ne se fait pas au centre de la croix visible, régler la vis de calibrage (voir la page Présentation) avec le tournevis fourni.
5. Nettoyer le prisme, le solide et le prisme supérieur si entré en contact avec le monobromide de naphtalène, avec de l'alcool pur et du coton
Ne pas racler le prisme, au risque de l'abîmer, mais plutôt le tapoter
Après le calibrage, ne plus toucher à cette vis. Si la mesure semble fausse, étalonner à nouveau.
# Réalisation d'une mesure
L'appareil étalonné, il devient possible de réaliser différentes mesures avec des liquides ou des solides, transparents ou translucides.
Le protocole varie en fonction de la nature de l'échantillon testé.
Attention : Le réfractomètre n'est utilisation qu'en présence de liquide/solides transparents et translucides, dès que le liquide/solide est sombre ou fortement colorée la mesure sera faussée
#### Mesure d'un liquide transparent ou translucide
- Déposer quelques goutes de votre liquide sur le prisme de réfraction à l'aide d'une pipette de manière homogène sur le prisme puis fermer ce dernier
- Ouvrir le cache-prisme (1.4) situé sur le dessus du prisme et fermer celui situé en dessous (1.6)
- Regarder dans l'oculaire où se positionne la ligne horizontale par rapport à la croix.
L'objectif de la manipulation qui suit est de positionner la ligne au centre de la croix
- Tourner la molette inférieure droite afin de positionner correctement la ligne horizontale.
- Regarder l'indice de réfraction
- Se référer aux courbes de valuers préexistantes
#### Mesure d'un solide transparent
- Le solide mesuré doit être lisse et avoir une face polie ( au moins celle mise en contact avec le prisme)
- Comme lors de l'étalonnage, placer une à deux gouttes de monobromide de naphtalène sur le prisme,
- Nettoyer la surface de l'objet mesurée et le positionner sur le prisme
- Fermer le plus possible le sans forcer le prisme
- Fermer le cache-prisme (1.4) situé sur le dessus du prisme et celui situé en dessous (1.6)
- Regarder dans l'oculaire où se positionne la ligne horizontale par rapport à la croix.
L'objectif de la manipulation qui suit est de positionner la ligne au centre de la croix
- Tourner la molette inférieure droite afin de positionner correctement la ligne horizontale.
- Regarder l'indice de réfraction
#### Mesure d'un solide translucide
- Le solide mesuré doit être lisse et avoir une face polie ( au moins celle mise en contact avec le prisme)
- Comme lors de l'étalonnage, placer une à deux gouttes de monobromide de naphtalène sur le prisme,
- Nettoyer la surface de l'objet mesurée et le positionner sur le prisme
- Fermer le plus possible le sans forcer le prisme
- Fermer le cache-prisme (1.4) situé sur le dessus du prisme et ouvrir celui situé en dessous (1.6)
- Regarder dans l'oculaire où se positionne la ligne horizontale par rapport à la croix.
L'objectif de la manipulation qui suit est de positionner la ligne au centre de la croix
- Tourner la molette inférieure droite afin de positionner correctement la ligne horizontale.
- Regarder l'indice de réfraction
#### Mesure concentration en sucre d'une solide
- Déposer quelques goutes de votre liquide sur le prisme de réfraction à l'aide d'une pipette de manière homogène sur le prisme puis fermer ce dernier
- Ouvrir le cache-prisme (1.4) situé sur le dessus du prisme et fermer celui situé en dessous (1.6)
- Regarder dans l'oculaire où se positionne la ligne horizontale par rapport à la croix.
L'objectif de la manipulation qui suit est de positionner la ligne au centre de la croix
- Tourner la molette inférieure droite afin de positionner correctement la ligne horizontale.
- Regarder l'indice de réfraction
- Dans ce cas, la concentration de sucre peut-être déterminée via l'échelle Brix (allant de 0 à 90%) située au dessus de la ligne de réfraction.
Tableur %sel / indice de réfraction :
[%sel / indice de refraction](https://docs.google.com/spreadsheets/d/1fg0MCjjeL93Ekl8hGXk1hLTAGDIjVLmzlqrITzqh6dA/edit#gid=0)
# Tableaux de valeurs
# LabSwift-aw - appareil de mesure de fraction d'eau libre
#### **Description générale**
LabSwift-aw est un appareil de mesure de fraction d'eau libre. La fraction est l'activité de l'eau (aw - water activity). La valeur de aw est comprise entre 0 (absolument sec) et 1 (absolument humide). Afin de déterminer aw l'équilibre hygrométrique est mesuré à travers la cellule électrolytique résistive intégré dans le capteur de aw. Le signal mesuré est également associé à une mesure de la température par IR (infrarouge).
#### **Aperçu**
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-12/labswift.jpg)
Il y a 3 touches de fonctions :
**1. Touche "Menu"** :
Mode Mesure : allume/éteint appareil (presser longtemps), accès aux menus
Mode Menu : accès aux paramétrages, passage du mode menu au mode mesure (presser longtemps)
**2. Touche "Actual/Stable"**
Mode Mesure : passage de la valeur mesure à la valeur stable
Mode Menu : descendre au mode menu, décrémenter
**3. Touche "Start/Stop"**
Mode Mesure : démarrage de la mesure, interruption de la mesure en cours, protocole de la mesure (presser longtemps)
Mode Menu : monter au mode menu, décrémenter
**Affichage**
Actual - Le symbole apparaît pendant une mesure.
Stable - Le symbole apparaît quand la mesure est stabilisée.
SD rec - Apparaît quand la fonction enregistrement est activée.
Ne jamais retirer la carte SD quand le symbole apparaît !
#### **Démarrage de l'appareil**
1. Vérifier les tensions d'alimentation secteur
2. Brancher le câble d'alimentation de votre LabSwift-aw
3. Appuyer ensuite sur la touche de mise en route
4. Le système montre (S TST) ; auto-test
5. Attendre 2-3 minutes (WARM UP)
6. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-12/cv4image.png)
7. Mettre l'échantillon dans une coupelle (remplir au 2/3, ne pas mettre en contact avec la cellule de mesure), placer la coupelle dans la chambre de mesure sans le couvercle et fermer l'appareil
8. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-12/1Auimage.png)
9. Démarrer la mesure : soit presser **la touche "Start/Stop"** soit programmer l'autostart dans le menu soit fermer le capot (la mesure va se démarrer automatiquement)
10. Lors de la mesure l'appareil affiche "Analyse", le symbole Actual apparaît pendant une mesure.
11. [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-12/JFpimage.png)
12. Ensuite on entend un "beep" qu'on peut éteindre avec **la touche "Start/Stop"**
13. Le symbole Stable apparaît quand la mesure est stabilisée.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2023-12/Nheimage.png)
La température et la valeur de aw apparaissent
*\*Pour sélectionner le mode d'affichage de mesure presser **la touche "Actual/Stable"***
Pour optimiser le temps de mesure, il est possible de choisir entre trois facteurs de stabilité :
**Accéder au menu --> Choisir à l'aide des flèches marquées sur les touches Start/Stop et Actual/Stable \*STAB --> Appuyer sur la touche menu --> Changer de mode avec les flèches --> Appuyer encore une fois sur la touche menu pour sauvegarder**
Pour sortir : Appuyer sur le flèches pour trouver EXIT --> Choisir EXIT et appuyer longtemps sur la touche "Menu" pour sortir
S Lent, temps de mesure : 6 minutes
A Moyen, temps de mesure : 4 minutes
F Rapide, temps de mesure : 2 minutes
0 le temps de mesure peut être programmé dans le menu "OBSTIME" (valeurs de 1 à 30 minutes)
#### **Calibration de l'appareil avec les sels SAL-T**
**Il y a 3 types de sel SAL-T**
Sel SAL-T **11**, Sel SAL-T **58** et Sel SAL-T **84**
1. Mettre **le facteur de stabilité en mode S** (Accéder au menu --> Choisir à l'aide des flèches marquées sur les touches Start/Stop et Actual/Stable \*STAB --> Appuyer sur la touche menu --> Changer de mode avec les flèches --> Appuyer encore une fois sur la touche menu pour sauvegarder)
2. Placer le sel SAL-T standard dans la chambre (avec/sans couvercle ?)
3. Fermer le capot
4. Attendre 45 minutes
5. Accéder au menu
6. Sélectionner \*CALIB **à l'aide des flèches marquées sur les touches Start/Stop et Actual/Stable** et ensuite CALXX
La déviation entre la valeur actuelle mesurée et la valeur de référence choisie "Point étalon" est visualisée. L'appareil reconnaît automatiquement l'étalon. Avec les touches d'autres points de calibrage peuvent être choisis.
6. Pressez ensuite **la touche "Menu"** pour valider le calibrage
Pour sortir : Appuyer sur le flèches pour trouver EXIT --> Choisir EXIT et appuyer longtemps sur la touche "Menu" pour sortir
*\*Pour effacer un ou tous les points de calibrage mémorisés --> CLR Cxx = effacer un seul point déterminé et ALL = effacer tous les points*
*\*\*Pour activer le mot de passe de 4 chiffres pour protéger le calibrage --> SET PSW (le code usine : 8808)*
#### **Paramétrages : System settings --> \*LCD**
**Accéder au menu --> Choisir \*LCD à l'aide des flèches marquées sur les touches Start/Stop et Actual/Stable \*STAB --> Appuyer sur la touche menu -->Changer de mode avec les flèches --> Appuyer encore une fois sur la touche menu pour sauvegarder**
Pour sortir : Appuyer sur le flèches pour trouver EXIT --> Choisir EXIT et appuyer longtemps sur la touche "Menu" pour sortir
CONTRA - contraste (de 0 à 9)
UNIT H - humidité/aw : valeur de aw ou d'hummidité %RH
UNIT T - température : °C ou °F
#### **Paramétrages : SD-Card --> \*SD LOG**
**Accéder au menu --> Choisir \*SD LOG à l'aide des flèches marquées sur les touches Start/Stop et Actual/Stable \*STAB --> Appuyer sur la touche menu -->Changer de mode avec les flèches --> Appuyer encore une fois sur la touche menu pour sauvegarder**
Pour sortir : Appuyer sur le flèches pour trouver EXIT --> Choisir EXIT et appuyer longtemps sur la touche "Menu" pour sortir
S NUMB - Des chiffres libres "de 0000-9999" qui vont s'incrémenter de 1 en 1 permettent de stocker les mesures
S INT - Les données seront sauvegardées à un intervalle de temps défini dans ce menu; pour des mesures standards préconisez un enregistrement toutes les 10 secondes
Tous les paramètres peuvent être **remis en configuration usine**, excepté les valeurs de calibrage stockées dans la cellule de mesure CM-2. Pour réinitialiser l'appareil, appuyer simultanément sur "ON" et la flèche du haut. "FA SET" apparaît, sélectionnez "YES" pour confirmer le retour en configuration usine.
#### **Consignes à respecter**
**• Ne laissez jamais tomber la cellule de mesure. Ne la nettoyez jamais**
**• N'effectuez pas de mesures sans avoir monté le filtre de protection**
**• Utilisez les filtres de protection adaptés aux produits mesurés (acides, alcools ou arômes)**
**• Les capteurs non utilisés doivent être conservés dans un endroit propre, dans des conditions de température et d'humidité ambiante**
**• Une chambre de mesure non utilisée doit rester vide et fermée**
**• Ne connectez pas le capteur à un multimètre ; cela aurait pour conséquence de le dégrader et ne serait pas couvert par la garantie**
# System Gold™ HPLC instrument
### **Qu'est-ce que l'HPLC :**
L'HPLC (High Performance Liquid Chromatography) est une technique de séparation analytique de molécules présentes dans un échantillon, ce qui permet leur analyse qualitative et quantitative. Dans cette technique, une phase mobile (éluant) et une phase stationnaire (colonne) permettent la séparation des molécules d'un échantillon en fonction de différents critères. Elle est utilisée par de nombreuses industries, comme la pharmacie et la bio-pharmacie, l'alimentation, la cosmétique...
En fonction de la colonne et de l'éluant choisi pour l'analyse, le type de chromatographie peut différer. Voici certains des différents types de chromatographies que nous pouvons réaliser :
- Chromatographie d'adsorption
- Chromatographie de partage (la plus utilisée):
- En phase normale. Les phases mobile et stationnaire sont polaires
- En phase inversée. La phase stationnaire est apolaire mais la phase mobile reste polaire
- Chromatographie par échange d'ions
- Chromatographie d'exclusion stérique (en fonction de la taille des molécules)
Il est important de se renseigner sur la compatibilité des solvants avec les colonnes avant de commencer une manipulation. Il est également nécessaires d'utiliser les bons éluants et colonnes en fonction des espèces pouvant être présentes dans un échantillon.
###
### **Description générale**
Le chromatographe HPLC que nous utilisons (Beckman Coulter System Gold) est une chaine composé de plusieurs sous blocs, chacun ayant une fonction qui lui est propre.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/th-beckmn-gold-125-166.jpg)*System GOLD HPLC*
##### 1) Pompe ou "Solvent Module" :
Le rôle de cette pompe est d'envoyer l'éluant (ou les éluants) sélectionné(s) à travers la chaine de chromatographie. Le modèle que nous utilisons est le "Solvent Module 126". Il permet un mélange de plusieurs solvants, afin d'éviter à avoir à préparer nous même des mélanges au préalable.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/system-gold-126-solvent-module-1.JPG)*Pompe "Solvent Module 126"*
Les flacons de solvant sont placés en haut de la colonne et sont reliés à des pompes A et B, qui permettent un mélange des solvants avec les rapports qui nous intéressent. Le flux débité par la pompe est ensuite envoyé directement vers le deuxième bloc du système HPLC, c'est-à-dire l’échantillonneur automatique (Autosampler). Tous les paramètres permettant de contrôler la pompe (débit, pressions minimale et maximale, choix des solvants pour les pompes A et B, rapport A:B) sont modifiés depuis l’ordinateur.
Si on ne veut pas envoyer notre éluant vers le reste du systeme HPLC (échantilloneur et détecteur), il suffit d'ouvrir la valve d'évacuation ("Drain Valve") : elle enverra tous l'éluant dans une bouteille "déchet".
##### 2) Échantillonneur automatique ou "Autosampler 507e"
L’échantillonneur est détecté en tant que "Autosampler 507e" par le logiciel 32 Karat, même s'il se nomme en réalité "Autosampler 508".
Le rôle de l'échantillonneur et de prélever automatiquement les différents échantillons préparés et placés au préalable dans des flacons situés sur une plaque tournante. Chaque emplacement est numéroté, et à chaque nouveau programme, l'échantillonneur commencera son prélèvement au premier flacon. Les flacons utilisés sont de petites tailles et sont tous dotés d'un bouchon spécial doté d'un septum, ce qui permet à l’échantillonneur de le percer avec une aiguille.

*Echantillonneur "Autosampler 507e"*
L'échantillonneur est aussi doté d'une bouteille qui permet le rinçage de la seringue entre chaque injection : elle peut être remplie avec du méthanol ou un mélange d'eau et isopropanol. Elle est ensuite accrochée à la machine, tout en faisant passer le tube de nettoyage par l'ouverture se trouvant sur le bouchon.
Afin d'envoyer notre échantillon vers la colonne et vers le détecteur, l'Autosampler est doté d'un système spécial INJECT/LOAD, ce qui permet d'envoyer une petite quantité d'échantillon vers la colonne : tant que l'échantillon n'est pas envoyé vers la colonne, il est éliminé ou bien il reste à l'intérieur du système INJECT/LOAD, jusqu'à ce qu'il soit envoyé vers la colonne.
##### 3) Colonnes
La colonne est directement rattachée au système INJECT/LOAD de l'échantillonneur et au détecteur. C'est elle qui permet la séparation des différentes molécules d'un échantillon, dont la présence sera ensuite confirmée par le détecteur. Il en existe différents types, chacune ayant des caractéristiques qui lui sont propres, et plus ou moins adaptés à certaines molécules et éluants.
La colonne est directement rattachée à la sortie 6 de l'échantillonneur, grâce à un tube en plastique fin, et est relié de la même manière au détecteur, vers une entrée qui consiste en un fin tube en métal. La colonne est vissée aux entrée et sortie afin d'éviter toute suite possible en dehors du système.
##### 4) Détecteur ou "Detector
Le détecteur (Detector 168) se situe à la fin de la chaine, et il permet de savoir à quel moment une molécule de l'échantillon sort de la colonne. Ce modèle de détecteur fonctionne à l'aide d'une lampa PDA, qui permet une analyse en 3 dimension de notre échantillon (temps, longueur d'onde et absorbance), ce qui permet de limiter le nombre de répétitions de manipulation, contrairement à une analyse UV-vis en 2 dimension, dans laquelle nous sommes limités à une longueur d'onde bien spécifique. Même si cette méthode est simple à utiliser, elle est limitée aux molécules qui absorbe les longueurs d'onde de l'UV ou du visible (complexes métalliques colorés, molécules organiques conjugués, cycles aromatiques...); pour notre détecteur, il s'agit des longueurs d'onde situées entre 190nm et 600nm. C'est pour cela qu'il est préférable d'utiliser comme éluant des composés n'absorbant pas en UV (eau, éthanol...).
Une fois que l'éluant passe à travers la colonne puis le détecteur, il est rejeté par en sortie par un "Back Pressure Regulator", afin d’empêcher à l'éluant de sortir avec une pression trop importante à la fin du circuit.
### Contrôle depuis l'ordinateur
Tous les différents blocs de la chaine HPLC peuvent être contrôlés depuis l'ordinateur.
##### Ouverture de la chaine
Aucune connaissance informatique n'est requise. L'ordinateur n'a pas de mot de passe.
Avant toute chose, il faut s'assurer que tous les éléments de la chaine soient allumé. Leurs interrupteurs sont tous placés à l'arrière de chaque bloc (il faut allumer séparément les différents constituants du système HPLC).
Une fois sur le bureau de l’ordinateur, il suffit d'ouvrir le logiciel "32 Karat Software". Une fois lancé, il faut cliquer sur "Chaine fonctionnelle", qui correspond à la chaine qui nous intéresse (le chargement pour l'ouverture de la chaine peut-être long).
##### Contrôle de l'HPLC à l'aide de Direct Control :
Une fois la chaine ouverte, on peut à présent ouvrir "Direct Control". Pour se faire, il faut cliquer sur "Control" puis sélectionner "Direct Control" dans le menu défilant. A ce moment, une nouvelle fenêtre apparait. Elle permet le contrôle direct de différents réglages sur la pompe, l’échantillonneur et le détecteur.
- La pompe : il est possible de régler le débit de la pompe en appuyant sur Flow Rate, puis en entrant la valeur de débit qui nous intéresse, allant jusqu'à 10 mL/min, et en cochant la checkbox "Flow On". Une fois prêt à lancer la pompe, il suffit d'appuyer sur OK. Si on veut arrêter la pompe, il faut à nouveau cliquer sur Flow Rate, puis décocher la checkbox "Flow ON", et appuyer sur OK. Pour réaliser des mélanges de solvants (A + B), il fut cliquer sur %B, puis choisir le ratio en pourcentage de A et de B en rentrant une valeur pour B, et confirmer notre choix en appuyant sur OK. Il est possible de choisir lequel des 4 solvants possibles les pompes A ou B vont utiliser en cliquant sur les flèches colorés afin qu'elles indiquent la couleur/le chiffre qui nous intéresse pour cette pompe. Enfin, on peut sélectionner les pressions minimales et maximales pour les pompes A et B en cliquant sur les icones de pompes correspondant à A ou à B, puis en choisissant les valeurs qui nous intéressent en kPSI ou en MPa ; on peut confirmer notre choix en cliquant OK.
- Le détecteur : on peut allumer la lampe en cliquant sur l’icône ressemblant à une lampe et en sélectionnant ON ou OFF. On peut également la calibrer en appuyant sur "Calibrate", puis en cliquant sur ON; il est également possible de choisir les longueurs d'onde de travail qui nous intéresse, en sélectionnant "Ch1"/"Ch2", puis en entrant les valeurs voulues.
Créer sa propre méthode
Le logiciel 32 Karat nous permet d'automatiser le processus d’échantillonnage en créant nos propres méthodes. Pour se faire, il faut se rendre dans le menu déroulant "Files", puis sélectionner "Method" et "New", ce qui ouvrira une nouvelle fenetre. Depuis cette fenetre, on peut influencer certains paramètres sur la pompe, le détecteur ou encore l'échantillonneur, et meme programmer des temps pour notre méthode.
Dans l'onglet Pumps, on peut configurer le contenu de chaque solvant (A1, A2, B1...), influencer le débit et sa durée, changer les valeurs de pression minimale ainsi que maximale et les mélanges en pourcentage entre A et B.
Dans l'onglet Detector, on peut choisir la plage de longueur d'onde sur laquelle les mesures seront réalisées, ainsi que l'intervalle de scan (2nm par défaut) si l'on veut réaliser des mesures de données en 3D. Si l'on veut réaliser une analyse 2D (intensité + temps), il suffit de décocher la checkbox 3D Data, puis de régler les paramètres dans la partie Channel Definition.
Dans l'onglet Injector, on peut régler l’échantillonneur afin qu'il nettoie l'aiguille entre chaque injection, qu'il permette ou non le uL Pickup, ou qu'il réalise le Tray Cooling, qui permet de garder les échantillon à des certaines températures (on peut également influencer d'autres paramètres, comme le volume de nettoyage "Wash Volume").
L'onglet Time Program nous permet de programmer directement en fonction du temps les actions que les différents blocs de l'HPLC devront réaliser à travers le temps.
Reglages de la pompe :
Une pompe mal réglée peut amener des bulles d'air dans le système, ce qui risque de fausser nos résultats ; c'est pour cela qu'il est primordial de la régler correctement.
\- Ouvrir la valve de drain en tournant le robinet dans le sens inverse des aiguilles d'une montre.
\- Insérer une seringue dans le port qui nous intéresse (A ou B), tourner l puis retirer le conten
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/c3gimage.png)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/heSimage.png)
**A) LES UNITÉS**
**1. L'ordinateur : application 32 KARAT SOFTWARE
**
NB : Aucune connaissance informatique n'est requise. L'ordinateur n'a pas de mot de passe.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/ordinateur-hplc.jpg)
Le logiciel Gold, apporte 3 niveaux d'interaction et de contrôle à la chromatographie haute performance.
1. **Gestionnaire pour 1 ou 2 systèmes HPLC**, repérés SYSTEM1 ( carte PCI1 ) et SYSTEM2 ( carte PCI2 ) , chaque système pouvant contenir jusqu'à 8 modules (pompes, détecteurs, interfaces etc...). Chaque système peut acquérir le résultat à deux longueurs d'onde), ces deux voies étant appelées CHANNEL A et CHANNEL B. En contrôle direct (direct control), ou en automatique au travers de méthodes (edit method), l'ordinateur coordonne le fonctionnement de chacun des modules HPLC. Bien qu'il soit prévu pour un fonctionnement avec des éléments BECKMAN, il peut être connecté à d'autres éléments au travers d'une interface (modèle 405) permettant des contrôles par des contacts de relais et/ou le traitement du signal d'un détecteur.
2. **Collecte les chromatogrammes des analyses effectuées**, les analyse, les transcrit en un rapport final, et/ou les stock, permettant ainsi un retraitement ultérieur. La calibration et les résultats des échantillons analysées sont réalisés facilement, le rapport final apparaît dans le format et avec les informations qui sont le plus appropriées.
3. **Retrait des résultats** (outil très puissant). Chaque donnée étant stockée en mémoire (sur disque dur ou sur disquette), il permet de réanalyser tout échantillon désiré pour corriger des erreurs ou déterminer l'effet de calibrations différentes. La puissance des analyses chromatographiques et des fonctions de balayage en longueurs d'onde permet une étude approfondie des résultats obtenus, non possible jusqu'à présent.
**3. Spectrofluorometric detector : RF-10 Axl**
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/devant-spectrofluorometre.jpg)
Spectrofluoromètre de face
| [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/8vRarriere-spectrofluorometre.jpg)
Arrière spectrofluoromètre
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[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/rSLcotes-droit-et-gauche-spectrofluorometre.jpg)
Côtés spectrofluoromètre
| [](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-01/cote-spectrofluorometre.jpg)
Dessous spectrofluoromètre
|
**Liens**
1. Manuel HPLC+software [https://www.artisantg.com/info/Beckman\_Coulter\_Model\_166\_Manual.pdf](https://www.artisantg.com/info/Beckman_Coulter_Model_166_Manual.pdf) dispo en papier
2. Manuel Foxy 200 [https://archive-resources.coleparmer.com/Manual\_pdfs/01471-xx.pdf](https://archive-resources.coleparmer.com/Manual_pdfs/01471-xx.pdf) dispo en papier
3. Manuel Sedex Model 80 [https://www.knauer.net/Dokumente/detectors/third\_party/manuals/sedere\_elsd\_80\_manual\_\_rev3.0\_\_release.pdf](https://www.knauer.net/Dokumente/detectors/third_party/manuals/sedere_elsd_80_manual__rev3.0__release.pdf) dispo en papier
Autre manuel papier dispo :
1. Installation & Maintenance Guide HPLC
2. P/ACE MDQ Basic Training Workbook
Un forum de FAQ [https://www.labwrench.com/forums/equipment/155/beckman-coulter-system-gold](https://www.labwrench.com/forums/equipment/155/beckman-coulter-system-gold)
# Détecteur à diffusion de lumière évaporative basse température
SEDERE LT-ELSD SEDEX 80LT
# Notice d'utilisation de l'appareil
[https://www.knauer.net/Dokumente/detectors/third\_party/manuals/sedere\_elsd\_80\_manual\_\_rev3.0\_\_release.pdf](https://www.knauer.net/Dokumente/detectors/third_party/manuals/sedere_elsd_80_manual__rev3.0__release.pdf)
# Refroidisseur Heidolph Hei-CHILL 250
# Utilisation de l’appareil
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-02/img-0375.jpeg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-02/img-0376.jpeg)
Utilisation primaire pour l’évaporateur rotatif Hei-VAP Core:
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-02/img-0374.jpeg)
**NOTICE UTILISATEUR :**
Lien vers la notice d’utilisateur: *[https://heidolph-instruments.com/documents/operation%20manuals/chiller/Operation-Manual-Chiller-Hei-CHILL%20250-1200.pdf](https://heidolph-instruments.com/documents/operation%20manuals/chiller/Operation-Manual-Chiller-Hei-CHILL%20250-1200.pdf)*
Lien du descriptif appareil : [https://heidolph-instruments.com/fr/produits/print/22647](https://heidolph-instruments.com/fr/produits/print/22647)
Description : Refroidisseur compact qui se positionne facilement sur une paillasse de laboratoire. Capacité de refroidissement de 250 W. Systèmes de commande clairement disposés, grand écran à LED, clavier à membrane et fenêtre pour la surveillance du niveau de liquide. Fonction de démarrage et d'arrêt automatique.
- Plage de températures de -10°C à +40°C. Stabilité à la température de ± 0,5 K. Capacité de refroidissement à +20°C : 250 W.
- Dimensions : L 200 x P 350 x H 465 mm
Exemples d'applications :
1\) **En chimie organique** : Dans la synthèse de composés organiques, il est souvent nécessaire de contrôler précisément la température lors de réactions exothermiques ou sensibles à la chaleur. Le refroidisseur peut maintenir une température constante dans un réacteur, ce qui est crucial pour obtenir des résultats reproductibles.
2\) **Extraction de solvants** : Lors de l'extraction de composés à partir de matrices complexes (par exemple, l'extraction de principes actifs à partir de plantes pour la préparation de médicaments), le refroidissement du solvant extrayant peut améliorer l'efficacité du processus tout en préservant la qualité des composés recherchés.
3\) **Purification par chromatographie** : Dans les techniques de chromatographie, le contrôle précis de la température peut améliorer la séparation des composés. Le refroidisseur peut maintenir une température constante dans le système de chromatographie liquide ou gazeuse, ce qui aide à obtenir des résultats plus fiables et reproductibles.
4\) **Synthèse de polymères** : Pour contrôler la vitesse de réaction et la taille des polymères synthétisés, le refroidisseur peut être utilisé pour maintenir des conditions de réaction spécifiques. Cela permet de contrôler la cinétique de réaction et les propriétés finales du polymère.
5\) **Culture cellulaire** : Dans certains protocoles de culture cellulaire, il est nécessaire de maintenir une température constante pour assurer la croissance cellulaire optimale. Le refroidisseur peut être utilisé pour refroidir les milieux de culture ou les incubateurs, fournissant ainsi un environnement stable pour les cellules.
Ce produit doit être utilisé avec un **liquide caloporteur avec une capacité thermique élevée** pour circuits de thermostatisation ouverts ou fermés (Mélange eau-Glycol avec une très bonne résistance au gel REACH et RoHs conforme). Un bidon de 5 litres de *KRYO 30 (marque Lauda)* peut être une bonne référence de liquide caloporteur.
Photographie du liquide de refroidissement Lauda Kryo 30 :
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-02/7L9img-0372.jpeg)
*Permet un refroidissement plus efficace sans utiliser de grandes quantités d’eau de robinet.*
# Caméra Microscope
# New Page
# Présentation de la caméra microscope OPTIKA
# Installation de la caméra sur le microscope
1. Sortir le boitier et l'adaptateur microscope de la boite et les assembler. (Bien penser à enlever les embouts de protections avant d'assembler)
2. inserer la caméra dans la lunette droite du microscope (Se mettre bien perpendiculaire pour ne rien abimer)
3. Brancher le chargeur de la caméra a une prise secteur.
4. brancher la cable hdmi à écran (ici la télé du labo)
5. brancher l'embout USB de la souris afin de pouvoir intéragir avec l'image envoyée sur la téléarte SD
Quelques exemples de prises de vue :
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/d0Aimg-0005.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/img-0013.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/img-0026.jpg)
cristaux de cuivre II sulfate cristaux de glucose coupe feuille
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/img-0036.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/img-0038.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/img-0040.jpg)
coupe feuille (2), stomates racine (1), poils absorbants racine(2), poils absorbants
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/img-0048.jpg)[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-03/img-0010.jpg)
cheveux de Maryam Chlamydomonas
# Tampons d'extraction
#### Introduction
Un étape importante dans l’analyse de protéines ou d'ADN, est l'extraction de ces derniers des tissus et la purification des solution obtenus. Ces étapes ont lieu dans une solution tampon (solution qui maintient un pH à peu près stable, malgré certains changements des facteurs externes ou internes).
En sélectionnant les solutions appropriées et en suivant la méthode adéquate pour extraire l'ADN, on pourrait :
- Maintenir un pH optimal tout au long du processus d'extraction.
- Rompre efficacement les membranes cellulaires et nucléaires.
- Préserver l'intégrité de l'ADN et prévenir sa dégradation.
- Séparer l'ADN des débris cellulaires et des contaminants.
#### I) Les étapes générales de l'utilisation des tampons d'extraction d'ADN
1\. Préparation des échantillons
\- Collecter les échantillons biologiques contenant l'ADN que vous souhaitez extraire. Cela peut être du sang, des tissus, des cellules, etc.
\- Préparer les échantillons en les broyant ou en les homogénéisant pour libérer les cellules et l'ADN à extraire.
2\. Préparation des tampons
\- Préparer les tampons d'extraction d'ADN nécessaires en suivant les protocoles spécifiques pour chaque type de tampon. Assurez-vous de respecter les concentrations et les conditions de pH recommandées.
3\. Lyse cellulaire
\- Ajouter le tampon de lyse à vos échantillons pour rompre les membranes cellulaires et nucléaires et libérer l'ADN. Les tampons de lyse contiennent souvent des agents détergents tels que le Triton X100, le SDS ou le CTAB pour dissoudre les membranes.
4\. Inactivation des enzymes
\- Si nécessaire, ajouter des agents inhibiteurs d'enzymes tels que l'EDTA pour empêcher la dégradation de l'ADN par des enzymes telles que les DNases ou les RNases.
5\. Précipitation de l'ADN
\- Ajouter des agents de précipitation ou des solutions de précipitation, tels que l'alcool isopropanol ou l'éthanol, pour précipiter l'ADN des solutions.
6\. Centrifugation et lavage
\- Centrifuger les échantillons pour séparer l'ADN précipité des autres composants cellulaires et des contaminants.
\- Laver l'ADN précipité avec de l'éthanol pour éliminer les résidus de tampon et d'autres contaminants.
7\. Réhydratation de l'ADN
\- Dissolver l'ADN précipité dans un tampon d'hydratation approprié, tel que TE (Tris-EDTA), pour le stockage ou pour le préparer à des analyses ultérieures.
8\. Analyse de l'ADN
\- L'ADN extrait peut être utilisé pour diverses applications, telles que la PCR (réaction de polymérisation en chaîne), le séquençage, l'électrophorèse sur gel, etc.
Il est important de suivre attentivement les protocoles spécifiques à chaque kit d'extraction ou à chaque méthode d'extraction d'ADN pour obtenir les meilleurs résultats.
#### II) Les tampons les plus courants en Biologie
1\) Tampon de chlorure de sodium (NaCl) :
\- Principe : Le tampon de NaCl est souvent utilisé pour ajuster la force ionique des solutions. Il est généralement préparé en dissolvant du chlorure de sodium dans de l'eau distillée.
\- Exemples d'utilisation : Extraction d'ADN, de protéines ou d'autres biomolécules, hybridation d'acides nucléiques, réactions enzymatiques.
\- Préparation :
1. Dissoudre le chlorure de sodium dans de l'eau distillée pour obtenir la concentration désirée.
2. Stériliser par autoclavage si nécessaire.
\- Utilisation :
1. Ajuster la force ionique des tampons ou des solutions de lavage dans diverses applications biologiques.
2. Utiliser comme tampon pour l'extraction d'ADN ou de protéines.
2\) Tampon d'acétate de sodium :
\- Principe : Le tampon d'acétate de sodium est utilisé pour maintenir un pH stable dans une plage légèrement acide (pH autour de 5). Il est composé d'acide acétique et de sel de sodium.
\- Exemples d'utilisation : Extraction d'ADN plasmidique, purification de protéines par précipitation, électrophorèse d'acides nucléiques.
\- Préparation :
1. Dissoudre l'acide acétique et le sel de sodium dans de l'eau distillée.
2. Ajuster le pH avec de l'acide acétique ou de l'hydroxyde de sodium jusqu'à obtenir le pH désiré.
\- Utilisation :
1. Utiliser comme tampon de précipitation pour la purification de protéines.
2. Ajuster le pH des solutions pour différentes applications en biochimie.
3\) Tampon de phosphate d'ammonium :
\- Principe : Ce tampon est utilisé pour maintenir un pH stable dans une plage légèrement acide (pH autour de 5 à 6). Il contient des sels de phosphate et d'ammonium.
\- Exemples d'utilisation : Extraction d'ADN, électrophorèse d'acides nucléiques, réactions enzymatiques.
\- Préparation :
1. Dissoudre les sels de phosphate et d'ammonium dans de l'eau distillée.
2. Ajuster le pH avec de l'acide phosphorique ou de l'ammonium hydroxyde jusqu'à obtenir le pH désiré.
\- Utilisation :
1. Utiliser comme tampon pour l'extraction d'ADN ou d'ARN.
2. Ajuster le pH des solutions pour différentes applications en biologie moléculaire.
4) Tampon de glycérine :
\- Principe : La glycérine est souvent utilisée comme additif dans les tampons pour améliorer la stabilité des échantillons biologiques, réduire l'évaporation et minimiser la dénaturation des protéines.
\- Exemples d'utilisation : Conservation des échantillons biologiques, stabilisation des protéines, préparation de milieux de culture.
\- Préparation :
1. Ajouter la glycérine à la concentration désirée dans le tampon choisi.
2. Mélanger soigneusement pour assurer une distribution homogène.
\- Utilisation :
1. Ajouter comme additif aux tampons pour améliorer la stabilité des échantillons biologiques.
2. Utiliser comme milieu de conservation pour les échantillons biologiques.
5\) Tampon de carbonate de sodium :
\- Principe : Le carbonate de sodium est utilisé pour maintenir un pH alcalin dans une plage donnée (généralement entre 9 et 11). Il est souvent utilisé pour la dissolution de protéines et la fixation des échantillons biologiques.
\- Exemples d'utilisation : Extraction de protéines membranaires, dissolution de protéines dans des solutions tampons, préparation de milieux de culture.
\- Préparation :
1. Dissoudre le carbonate de sodium dans de l'eau distillée.
2. Ajuster le pH avec de l'acide chlorhydrique ou de l'hydroxyde de sodium jusqu'à obtenir le pH désiré.
\- Utilisation :
1. Utiliser comme tampon alcalin pour la lyse cellulaire ou l'extraction de protéines membranaires.
2. Ajuster le pH pour différentes applications en biochimie et biologie moléculaire.
6\) Tampon de Tris-EDTA (TE) :
\- Principe : Le tampon de Tris-EDTA est utilisé pour l'extraction, la purification et la conservation de l'ADN. Il contient du Tris pour le maintien du pH et de l'EDTA pour inhiber les enzymes endogènes qui dégradent l'ADN.
\- Exemples d'utilisation : Conservation d'échantillons d'ADN, dilution d'échantillons d'ADN pour la PCR, réhydratation de l'ADN lyophilisé.
\- Préparation :
1. Dissoudre le Tris et l'EDTA dans de l'eau distillée.
2. Ajuster le pH avec de l'acide chlorhydrique ou de l'hydroxyde de sodium jusqu'à obtenir le pH désiré.
\- Utilisation :
1. Utiliser comme tampon pour l'extraction, la purification et la conservation de l'ADN.
2. Diluer les échantillons d'ADN pour la PCR ou d'autres analyses moléculaires.
7\) Tampon de carbonate-bicarbonate de sodium :
\- Principe : Ce tampon est utilisé pour maintenir un pH alcalin dans une plage donnée, généralement entre 9 et 10. Il est couramment utilisé dans les applications biochimiques et biologiques nécessitant un milieu alcalin.
\- Exemples d'utilisation : Réactions d'immobilisation de protéines sur des supports solides, culture de cellules en milieu alcalin, réactions d'hybridation d'acides nucléiques.
\- Préparation :
1. Dissoudre le carbonate de sodium et le bicarbonate de sodium dans de l'eau distillée.
2. Ajuster le pH avec de l'acide chlorhydrique ou de l'hydroxyde de sodium jusqu'à obtenir le pH désiré.
\- Utilisation :
1. Utiliser comme tampon alcalin dans les réactions biochimiques nécessitant un pH élevé.
2. Préparer des milieux de culture cellulaires avec un pH alcalin pour certaines lignées cellulaires spécifiques.
8\) Tampon Tris-glycine :
\- Principe : Ce tampon est constitué de Tris et de glycine et est utilisé pour des applications de séparation et d'électrophorèse de protéines. Il offre une bonne résolution et une séparation efficace des protéines dans les gels de polyacrylamide.
\- Exemples d'utilisation : Electrophorèse sur gel de polyacrylamide (SDS-PAGE), transfert de protéines sur membrane (Western blot), électrophorèse bidimensionnelle (2D-PAGE).
\- Préparation :
1. Dissoudre le Tris et la glycine dans de l'eau distillée.
2. Ajuster le pH avec de l'acide chlorhydrique ou de l'hydroxyde de sodium jusqu'à obtenir le pH désiré.
\- Utilisation :
1. Préparer des gels de polyacrylamide pour l'électrophorèse en utilisant ce tampon comme tampon de migration.
2. Utiliser dans les tampons de transfert pour le transfert de protéines sur membrane dans les techniques de Western Blot.
9\) SDS (Dodécyl Sulfate de Sodium) :
\- Principe : Le SDS est un détergent ionique utilisé dans les applications de biochimie et de biologie moléculaire pour dénaturer les protéines et les rendre linéaires avant l'électrophorèse.
\- Exemples d'utilisation : SDS-PAGE (électrophorèse sur gel de polyacrylamide en présence de dodécyl sulfate de sodium), extraction de protéines membranaires.
\- Préparation : N/A, le SDS est généralement acheté sous forme de poudre et ajouté directement aux solutions.
\- Utilisation :
1. Ajouter à des échantillons protéiques pour les dénaturer avant l'électrophorèse sur gel.
2. Utiliser dans les tampons d'extraction pour solubiliser les protéines membranaires.
10\) CTAB (Chlorure de Cetyltriméthylammonium) :
[(source: https://www.slideshare.net/slideshow/different-methods-of-dna-isolation/249634941)](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/Xm0image.png)
\- Principe : Le CTAB est un tensioactif cationique utilisé dans l'extraction d'ADN pour lyser les membranes cellulaires et séparer l'ADN des protéines et des polysaccharides.
\- Exemples d'utilisation : Extraction d'ADN végétal ou fongique, isolation d'ADN extrachromosomique.
\- Préparation : Dissoudre le CTAB dans de l'eau stérile pour obtenir la concentration désirée.
\- Utilisation :
1. Utiliser comme composant principal dans les tampons d'extraction pour rompre les membranes cellulaires et libérer l'ADN.
2. Ajouter à des solutions de précipitation pour séparer l'ADN des contaminants protéiques et polysaccharidiques.
11\) Triton X100 :
\- Principe : Le Triton X100 est un détergent non ionique utilisé pour solubiliser les membranes cellulaires, les lipides et les protéines membranaires.
\- Exemples d'utilisation : Lyse cellulaire, extraction de protéines membranaires, préparation de lysats cellulaires pour diverses analyses.
\- Préparation : N/A, le Triton X100 est généralement acheté sous forme liquide et utilisé tel quel.
\- Utilisation :
1. Ajouter au tampon de lyse pour solubiliser les membranes cellulaires et les composants membranaires.
2. Utiliser comme additif dans les tampons de lavage pour éliminer les contaminants membranaires des échantillons.
12\) MgCl2 (Chlorure de Magnésium) :
\- Principe : Le MgCl2 est un sel de magnésium couramment utilisé dans de nombreuses réactions enzymatiques comme cofacteur, notamment dans les réactions de polymérisation d'ADN.
\- Exemples d'utilisation : Réactions d'amplification d'ADN telles que la PCR, séquençage d'ADN, réactions d'enzyme de restriction.
\- Préparation : Dissoudre le MgCl2 dans de l'eau stérile pour obtenir la concentration désirée.
\- Utilisation :
1. Ajouter aux mélanges de réaction d'amplification d'ADN pour activer les enzymes telles que les ADN polymérases.
2. Utiliser comme composant dans les tampons de réaction enzymatique nécessitant du magnésium.
13\) KCl (Chlorure de Potassium) :
\- Principe : Le KCl est un sel de potassium utilisé dans de nombreux tampons et solutions pour ajuster la force ionique, notamment dans les réactions enzymatiques et les réactions d'hybridation d'acides nucléiques.
\- Exemples d'utilisation : Extraction d'ADN, réactions d'hybridation d'ARN, électrophorèse sur gel.
\- Préparation : Dissoudre le KCl dans de l'eau stérile pour obtenir la concentration désirée.
\- Utilisation :
1. Ajuster la force ionique des tampons d'extraction pour favoriser les interactions protéine-ADN.
2. Utiliser comme composant dans les tampons de lavage pour éliminer les contaminants des échantillons.
14\) CsCl (Chlorure de Césium) :
(Cette méthode est fastidieuse et difficile à mettre en œuvre car elle nécessite une centrifugation à grande vitesse (100 000 tr/min) pendant plus de 10 heures)
\- Utilisation :
1. L'ADN est séparé en fonction de sa densité par centrifugation
2. Lors de la centrifugation à grande vitesse, au point isopycnique où la densité de l'ADN et le gradient (CsCl) deviennent identiques, la bande d'ADN apparaîtra
#### III) Les techniques biologiques pour lesquelles on utilise les tampons d'extraction
##### 1) Extraction d'acide nucléique de plantes
1\) Transformer les plantes lyophilisés ou déshydratés (congelés), en fine poudre.
2\) Ajouter la poudre dans une solution tampon d'extraction CTAB (env. 1mL pour 30-50 mg de tissus, le ratio exact dépendant du type de la plante).
3\) Incuber la solution obtenu pendant 60 min, à une température entre 55 et 60 °C, en mélangeant occasionnellement.
4\) Ajouter une quantité égale de solution de chloroforme et d'alcool isoamyl (24 : 1), et mélanger.
5\) Centrifuger, à température ambiante, la solution obtenue, à 1 000-5 000 g, pendant 30 à 50 min.
6\) Transférer la phase aqueuse (supérieure), à l'aide d'une pipette large, dans un tube en verre.
7\) Ajouter 2.5 volumes de EtOH (-20°C), ou 0.6-1 volume d'isopropanol (-20°C), et mélanger délicatement jusqu'à la précipitation de l'ADN.
- Si les brins d'ADN ne sont pas immédiatement visible, il est possible de laisser la solution reposer quelques jours ou même une nuit entière.
8\) Repêcher les brins d'ADN, en utilisant une pipette de Pasteur scellée et incurvée et les transférer dans 10-20 mL, d'une solution de 75% d'EtOH et de 10mM de solution d’acétate d'ammonium. Incuber pendant 20 min, à température ambiante en mélangeant de temps en temps. Répéter une à deux fois.
- Il est possible de faire une pause à cette étape, les brins d'ADN peuvent séjourner même un ou deux jours dans la solution de lavage.
9\) Placer l'ADN dans un tube pour microfuge et laisser sécher à l'air libre pendant une quinzaine de minutes.
10\) Dissoudre l'ADN dans 200-800 µL de solution stérile de tampon TE (10mM tris-Ha, 1mM EDTA, pH 7.4) et centrifuger dans une microfuge avec une force de 13 000 µg pendant 10 min.
11\) Mesurer la concentration en ADN et la réajuster pour avoir une concentration d'environ 0.5-0.7 µg/µL
##### 2) Protéines
##### 3) L'isolation d'ADN plasmidique
**Protocole d'Isolation d'ADN Plasmidique par Lyse Alcaline**
**Matériel requis :**
\- Eppendorfs stériles
\- Centrifugeuse
\- Tubes à centrifuger
\- Pipettes
\- Incubateur à température appropriée
\- Réfrigérateur
\- Colonne de purification d'ADN ou kit d'extraction d'ADN plasmidique (en option)
**Réactifs :**
\- Solution de Remise en Suspension :
\- 50 mM Tris HCl, pH 8
\- 10 mM EDTA
\- 100 µg/ml RNase A
\- Solution de Lyse :
\- 0,2 N NaOH
\- 1 % de SDS (sodium dodécyl sulfate)
\- Acétate de potassium à 3/5 M, pH 6 (solution de neutralisation)
\- Isopropanol
\- Éthanol à 70 %
\- Eau stérile ou solution tampon TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA, pH 8)
**Procédure :**
1\. Préparation des Échantillons
\- Prélevez 1 à 5 ml de culture bactérienne en croissance logarithmique contenant le plasmide.
\- Transférez la culture dans un tube à centrifuger et centrifugez à 3000 x g pendant 5 minutes pour récolter les cellules bactériennes.
2\. Lyse des Cellules Bactériennes
\- Retirez le surnageant et resuspendez les cellules dans 200 µl de Solution de Remise en Suspension contenant RNase A.
\- Incubez les échantillons à 37°C pendant 30 minutes pour digérer l'ARN.
\- Ajoutez 200 µl de Solution de Lyse (0,2 N NaOH + 1 % SDS) et mélangez délicatement en inversant plusieurs fois le tube.
\- Incubez les échantillons à température ambiante pendant 5 à 10 minutes pour permettre la lyse des cellules.
3\. Neutralisation de la Solution de Lyse
\- Ajoutez 300 µl d'acétate de potassium (3/5 M, pH 6) à chaque échantillon et mélangez doucement en inversant le tube plusieurs fois.
\- Incubez les échantillons sur glace pendant 10 minutes pour permettre la coagulation des protéines et des débris cellulaires.
4\. Précipitation de l'ADN Plasmidique
\- Centrifugez les échantillons à 12 000 x g pendant 10 minutes à température ambiante pour précipiter l'ADN plasmidique.
\- Retirez délicatement le surnageant sans perturber le précipité d'ADN.
5\. Lavage de l'ADN Précipité
\- Lavez le précipité d'ADN avec 1 ml d'éthanol à 70 % en centrifugeant à 12 000 x g pendant 5 minutes.
\- Retirez l'éthanol avec une pipette et laissez sécher le précipité d'ADN à température ambiante pendant quelques minutes.
6\. Réhydratation de l'ADN Plasmidique
\- Dissolvez l'ADN précipité dans 50 µl d'eau stérile ou de solution tampon TE en incubant à 65°C pendant quelques minutes ou en agitant doucement.
7\. Analyse de l'ADN Plasmidique
\- Analysez la pureté et la concentration de l'ADN plasmidique isolé en utilisant la spectrophotométrie UV ou d'autres méthodes d'analyse.
##### 4) L'extraction d'ADN à partir de cellules de mammifères
**Protocole d'Extraction d'ADN à partir de Cellules de Mammifères**
**Matériel requis :**
\- Eppendorfs stériles
\- Centrifugeuse
\- Tubes à centrifuger
\- Pipettes
\- Réfrigérateur
**Réactifs :**
\- Solution de Lyse d'ADN :
\- 0,1 M EDTA, pH 8,0
\- 0,5 % (p/v) de FDS (sodium dodécyl sulfate)
\- 10 mM Tris-Cl, pH 8,0
\- RNase pancréatique sans DNase à une concentration de 20 μg/ml (à ajouter juste avant utilisation)
**Procédure :**
1\. Préparation des Échantillons
\- Récoltez les cellules de mammifères par centrifugation et éliminez le milieu de culture.
\- Lavez les cellules avec du PBS (tampon phosphate salin) ou un tampon de votre choix pour éliminer les résidus de milieu de culture.
2\. Lyse des Cellules de Mammifères
\- Ajoutez 200 µl de Solution de Lyse d'ADN à chaque échantillon de cellules de mammifères.
\- Mélangez délicatement en pipetant ou en agitant doucement le tube.
\- Incubez les échantillons à température ambiante pendant 5 à 10 minutes pour permettre la lyse des cellules.
3\. Traitement avec RNase
\- Ajoutez la RNase pancréatique sans DNase à une concentration finale de 20 μg/ml juste avant utilisation.
\- Incubez les échantillons à 37°C pendant 30 minutes pour digérer l'ARN.
4\. Centrifugation et Collecte de l'ADN
\- Centrifugez les échantillons à 12 000 x g pendant 10 minutes pour séparer les débris cellulaires et les protéines de l'ADN.
\- Transférez soigneusement le surnageant (contenant l'ADN) dans un nouveau tube propre.
5\. Analyse de l'ADN
\- Analysez la pureté et la concentration de l'ADN extrait en utilisant la spectrophotométrie UV ou d'autres méthodes d'analyse.
##### 5) L'extraction d'ADN à partir d'échantillons de sang
**Protocole d'Extraction d'ADN à partir d'Échantillons de Sang**
**Matériel requis :**
\- Eppendorfs stériles
\- Centrifugeuse
\- Tubes à centrifuger
\- Pipettes
\- Réfrigérateur
**Réactifs :**
\- Tampon de Lyse pour les Globules Rouges (pH 7,6) :
\- 0,155 mol/L NH4Cl
\- 10 mmol/L KHCO3
\- 0,1 mol/L EDTA (Na2)
\- 20 μg/ml de RNase pancréatique sans DNase (ajouter juste avant l'utilisation)
\- Tampon d'Extraction à base de CTAB (pH 8,0) :
\- 1,5 mol/L Tris, pH 7,6
\- 0,4 mol/L Na2 EDTA
\- 2,5 mol/L NaCl
\- 2 % CTAB (bromure de cétyltriméthylammonium)
\- 10 % SDS (dodécylsulfate de sodium)
\- β-mercaptoéthanol
\- Mélange de chloroforme et d'alcool isoamylique (24:1)
\- Isopropanol
\- Éthanol à 70 % et 90 %
**Procédure :**
1\. Lyse des Globules Rouges
\- Mélangez 1 volume de sang avec 5 volumes de Tampon de Lyse pour les Globules Rouges.
\- Incubez à température ambiante pendant 10 minutes pour lyser les globules rouges.
2\. Traitement avec RNase
\- Ajoutez 20 μg/ml de RNase pancréatique sans DNase au mélange juste avant utilisation.
\- Incubez à 37°C pendant 30 minutes pour digérer l'ARN.
3\. Lyse Cellulaire avec le Tampon d'Extraction à base de CTAB
\- Ajoutez une quantité égale de Tampon d'Extraction à base de CTAB au mélange de sang lyse.
\- Incubez à 65°C pendant 10 minutes pour lyser les cellules et dénaturer les protéines.
4\. Extraction de l'ADN avec le Mélange de Chloroforme et d'Alcool Isoamylique
\- Ajoutez une quantité égale de Mélange de Chloroforme et d'Alcool Isoamylique au mélange et mélangez vigoureusement.
\- Centrifugez à 12 000 x g pendant 10 minutes pour séparer les phases.
5\. Précipitation de l'ADN avec de l'Isopropanol
\- Transférez la phase aqueuse (contenant l'ADN) dans un nouveau tube et ajoutez une quantité égale d'isopropanol.
\- Incubez à température ambiante pendant 10 minutes pour précipiter l'ADN.
6\. Lavage et Élution de l'ADN
\- Lavez l'ADN précipité avec de l'éthanol à 70 % et éliminez l'éthanol résiduel.
\- Éluez l'ADN précipité dans de l'eau stérile ou une solution tampon TE.
7\. Analyse de l'ADN
\- Analysez la pureté et la concentration de l'ADN extrait en utilisant la spectrophotométrie UV ou d'autres méthodes d'analyse.
##### 6) La dissolution des spermatozoïdes et l'extraction d'ADN
**Protocole de Dissolution des Spermatozoïdes et d'Extraction d'ADN**
Les méthodes d'extraction d'ADN généralement employées pour les cellules somatiques humaines se révèlent inefficaces pour les spermatozoïdes en raison de la compaction nucléaire et de la stabilité de l'ADN propres à ces cellules. Ainsi, un protocole spécifique est nécessaire pour dissoudre les spermatozoïdes et extraire leur ADN de manière appropriée.
**Matériel requis :**
\- Eppendorfs stériles
\- Centrifugeuse
\- Tubes à centrifuger
\- Pipettes
\- Réfrigérateur
**Réactifs :**
\- Tampon de Lyse (10x) : (ajouter de l'eau pour obtenir le volume final)
\- 5 ml de Tris-HCl à une concentration de 1 M
\- 1 ml de NaCl à une concentration de 5 M
\- 2,5 ml de MgCl2 à une concentration de 1 M
\- 41,5 ml d'eau
- Solution ARN-Plus : 500 µL
\- Protéinase K : 50 µL
\- Chloroforme : 500 µL
\- Éthanol froid pur : 800 µL
\- Citrate de sodium 3 M : 40 µL (maintenu à basse température)
\- Éthanol à 70 %
**Pour la Réhydratation :**
\- Tris–HCl ou eau distillée et déionisée (ddH2O)
**Procédure :**
1\. Lyse des Spermatozoïdes
\- Mélangez 1 volume de Tampon de Lyse (10x) à 9 volumes d'échantillon contenant les spermatozoïdes.
\- Incubez à température ambiante pendant 10 minutes pour lyser les spermatozoïdes.
2\. Traitement avec Protéinase K
\- Ajoutez 500 µL de Solution ARN-Plus et 50 µL de Protéinase K à chaque échantillon.
\- Incubez à 37°C pendant 1 heure pour digérer les protéines.
3\. Extraction de l'ADN avec du Chloroforme
\- Ajoutez 500 µL de chloroforme à chaque échantillon et mélangez vigoureusement.
\- Centrifugez à 12 000 x g pendant 10 minutes pour séparer les phases.
\- Transférez la phase aqueuse (contenant l'ADN) dans un nouveau tube.
4\. Précipitation de l'ADN
\- Ajoutez 800 µL d'éthanol froid pur à la phase aqueuse.
\- Ajoutez 40 µL de citrate de sodium 3 M à basse température.
\- Incubez à -20°C pendant 1 heure ou à température ambiante pendant 10 minutes pour précipiter l'ADN.
5\. Lavage et Élution de l'ADN
\- Lavez l'ADN précipité avec de l'éthanol à 70 % et éliminez l'éthanol résiduel.
\- Éluez l'ADN précipité dans du Tris–HCl ou de l'eau distillée et déionisée.
6\. Analyse de l'ADN
\- Analysez la pureté et la concentration de l'ADN extrait en utilisant la spectrophotométrie UV ou d'autres méthodes d'analyse.
#### Conclusion
En conclusion, les tampons d'extraction jouent un rôle crucial dans la purification et la préservation de l'ADN et des protéines lors des procédures d'analyse biologique. Le choix approprié du tampon et le respect des protocoles spécifiques garantissent le maintien du pH optimal, la lyse efficace des cellules, la séparation des composants cellulaires et des contaminants, ainsi que la préservation de l'intégrité des molécules ciblées. Ces tampons offrent une variété de compositions et de pH adaptés à différentes applications, ce qui en fait des outils indispensables pour les techniques d'extraction et d'analyse en biologie moléculaire et cellulaire.
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#### *Les liens qui peuvent être intéressants ... :*
**[DNA extraction methods using magnetic beads](https://www.gilson.com/default/learninghub/post/a-guide-to-using-magnetic-beads-for-rna-and-dna-extraction.html)**
**[DNA extraction using anion exchange resins](https://www.qiagen.com/us/knowledge-and-support/knowledge-hub/technology-and-research/plasmid-resource-center/qiagen-anion-exchange-resin)**
# Transfert de protéine semi-sec sur membrane
L'immunobuvardage est une technique servant à détecter une protéine. Pour pouvoir réaliser l'immunobuvardage, il est nécessaire dans un premier temps de séparer les protéines présentes au sein du gel et de les transférer sur une membrane. La machine présenté ci-dessous permet de réaliser ces deux tâches.
La séparation des protéines se fait par Electrophorèse. Sous l'effet d'un champs électrique, la séparation des particules se fait en fonction de leur charge et/ou de leur taille. Justement, cet outil permet de créer ce champs électrique.
[](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/kgPimage.png)
Utilisation :
- déposer deux filtre papier entre les deux plaques
- entre les deux papier, déposer la membrane sur laquelle les protéines vont être transférés ainsi que le gel
- bracher la plaque du haut à la borne négative d'un générateur (i.e la masse) et la plaque d'en dessous à la borne positive du générateur.
Attention : il faut faire attention à ne pas dépasser la tension maximal qui est de **200 volts DC** (direct current) et le courant qui est de **200 mA**. Voici une formule du champ électrique vous permettant d'ajuster la tension afin d'avoir le champ souhaité : **E = |U|/d**
**d** : distance entre les deux plaques
**U** : tension parcourant les deux plaques
Le temps de la manipulation peut varier selon le type de gel et de la membrane utilisé.
[ ](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/uploads/images/gallery/2024-04/img-5937.JPG)
# Imprimante résine ELEGOO Saturn
# Calibration de la plateforme
Pour procéder à la calibration de la plateforme, il faut:
Matériel:
- la clé allen dédiée: [Clé allen.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/713)
- le papier de nivellement: [Leveling paper.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/714)
Etapes à suivre:
- Allumer l’imprimante
- Enlever la cloche en plastique
- Verifier si la plateforme de construction est bien attachée (avec la vis entourée en vert) et dévisser les vis démarqués en rouge pour permettre a la plateforme (entourée en bleu) de pivoter [Building platform.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/716)
- Dévisser la cuve[ Cuve.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/715)
- L’enlever et placer le papier de nivellement en le calant ainsi [Nivellement.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/717)
- Sur l’écran, appuyer sur « Tool » , puis « Manual » et enfin le logo avec une maison pour remettre la plateforme à la position z0. [Tools.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/718) => [Manual.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/719) => [Home.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/720)
-
- Une fois la position atteinte, verifier l’alignement de la plateforme avec le papier de nivellement [Alignement.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/722), puis, une fois la plateforme remise en position optimale, resserrer les vis à l’aide de la clé allen [Vis plateforme.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/723)
- Une fois la plateforme fixée en position rigide, revenir dans le menu « Tool », « Manual » et sélectionner l’option 0.10mm, puis soulever la plateforme très légèrement jusqu’à ce que le papier de calibration puisse bouger mais en rencontrant toujours une résistance de la plateforme.
- [0.10mm.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/721)
-
- Une fois la bonne position atteinte, revenir dans « Tools », puis « set Z=0 » pour définir cette position comme la position de départ [Set Z=0.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/724)
- Finalement, aller dans « Tool », « Manual » puis sélectionner l’option 10mm et appuyer autant de fois sur la flèche de haut que nécessaire pour remonter la plateforme jusqu’à la position de départ.[10mm.jpeg](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/attachments/725)
- Remettre et revisser la cuve.
Lien tuto YouTube: [https://www.youtube.com/watch?v=3AmnRFHuCto](https://www.youtube.com/watch?v=3AmnRFHuCto)
# Introduction
Pour les curieux, à voir : **[Stéréolithographie](https://fr.wikipedia.org/wiki/St%C3%A9r%C3%A9olithographie)**
Dans le monde de l'ingénierie d'aujourd'hui, les méthodes d'impression 3D pour la fabrication additive sont généralement divisées en deux, l'une étant réalisée avec des matériaux comme le PLA et l'ABS (composants à base de plastique) ou la résine.
L'impression 3D en résine est généralement préférée car elle permet de réaliser des pièces avec des détails fins, des surfaces lisses, le plus haut niveau de précision et d'exactitude en employant aussi une méthode qui permet de rassurer **l'isotropie** - les imprimantes 3D généralement font des pièces une "couche" à la fois, donc la résitance de l'impression peut dépendre de son orientations dans les axes X,Y,Z du plateau.
Comment ça marche ? Pour l'expliquer avec les termes les plus simples possibles, le processus de l'imprimante résine envoie de la UV dans un réservoir de liquide (de la résine) déclenchant une réaction qui solidifie la résine en un plastique dur.
Vous voulez concevoir un tel projet ? Alors on vous invite à regarder le chapitre intitulé "[Imprimante résine ELEGOO Saturn](https://wiki.fablab.sorbonne-universite.fr/BookStack/books/appareils-biologie-chimie/chapter/imprimante-resine-elegoo-saturn)" pour plus d'information sur la machine **Elegoo Saturn** qui fait exactement ça !