====== EVALUATION DE LA LUTTE BIOLOGIQUE INTEGREE CHEZ LE FRAISIER CULTIVE EN HYDROPIE !en cours! ======

Porteur(s) du projet: **nomporteurdeprojet** (contact : [[elise.chatillon@etu.upmc.fr|elise.chatillon@etu.upmc.fr ; zoe.ribeyre@etu.upmc.fr]])\\
Suivie par Christophe Bailly (contact : [[christophe.bailly@upmc.fr|christophe.bailly@upmc.fr]])

  * Date de début : sept/2016
  * Les objectifs de ce projet
  * Conduite d'un projet innovant en collaboration avec une start-up spécialisée dans l'agriculture urbaine
  * Efficacité d'un biostimulant fongique dans un contexte de culture hydroponique par approche culturale   
     * Réisolement du fungi d'intérêt
     * Tests d'antagonisme
  * Date de fin estimée : janv/2017


===== Machines nécessaires =====

exemple :

{{https://www.memmert.com/products/incubators/peltier-cooled-incubator/IPP260plus/}}\\
- incubateur (Ici IPP260+) 

{{http://www.dutscher.com/frontoffice/product?referenceId=777346}}\\
- milieu de culture microbiologique PDA Potatoe Dextrose Agar


{{http://www.adslaminaire.com/catalogue/materiels/hotte-a-flux-laminaire-horzontal/9-non-categorise/79-hotte-a-flux-laminaire-optigel}}\\
- hotte à flux laminaire: manipuler dans des conditions stériles

{{http://www.adslaminaire.com/catalogue/materiels/hotte-a-flux-laminaire-horzontal/9-non-categorise/79-hotte-a-flux-laminaire-optigel}}\\
- pHmètre 

===== Construction =====

====Faisabilité du projet====

===Pré-tests===
   *les fungis utilisés sont-ils cultivables in vitro?
   *obtenir une souche de fungi phytopathogène pour les test d'antagonisme

===Mise en route de l'incubateur et programmation===

==== Protocoles ====

== Milieu de culture PDA ==

Se reporter à la notice d'utilisation.

Déterminer la quantité de poudre nécessaire pour le volume de milieu désiré (produit en croix). 

Introduire dans une bouteille pouvant être autoclavée. 

Compléter avec 2/3 de l'eau distillée nécessaire.

Mélanger à l'aide d'un agitateur magnétique.

Ajouter le reste de l'eau.

Mesurer le pH et ajuster (se reporter à la notice pour le pH optimal) si nécessaire avec une solution KOH.

Autoclaver. 

Couler les boîtes sous hotte.

== Test d'antagonisme ==

__Matériel__

boîte à pétri

Eau distillée stérile pour imbiber le papier filtre et le garder humide tout le long de l'expérience

Boîte à pétri

Papier filtre stérile rond adaptée à la taille du fond d'une boîte à pétri

Echantillons biologiques: CTL et traité 

souche de fungi phytopathogène ici Botritys cinerea (nécrotrophe)  

__Principe__

Dans des conditions stériles, on dépose un explant issu de la culture in vitro du fungi phytopathogène que l'on dépose sur les échantillons. Ces derniers sont déposés sur le papier filtre humidifié dans la boîte à pétri. Les boîtes sont entreposées dans l'incubateur et l'on suit au cours du temps la macération des tissus suivant la condition testée.

== Empreinte ==

__Matériel__

boîtes à pétri contenant du milieu PDA
hott
échantillons CTL et traités

__Principe__

Réisolement du champignon d'intérêt 

dans des conditions stériles, on applique l'échantillon sur le milieu PDA. On s'assure que toute la surface de l'échantillon est entré en contact avec le milieu. Pour cela, on tapote légèrement avec la pince. On répète l'opération sur toutes les faces de l'échantillon. On retire l'échantillon. Les boîtes sont mises dans l'incubateur. On suit l'apparition des fungi et en particulier celui d'intérêt.

===== Journal de bord =====

  * septembre/octobre: élaboration protocoles, prise en main du matériel, programmation du phytotron et pré-tests

  * 07 nov: maj doku wiki et suivi de culture de //B.c.//
  * 10 nov: coulage de boîte milieu PDA X8 et repiquage //B.c.//; nettoyage du phytotron
  * 13 nov-26 nov: absentes